Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ94

Ssna1, Sjoegren syndrome nuclear autoantigen 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssna1Q9JJ94 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ssna1Q9JJ94 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ssna1Q9JJ94 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ssna1Q9JJ94 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ssna1Q9JJ94 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ssna1Q9JJ94 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ssna1Q9JJ94 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ssna1Q9JJ94 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ssna1Q9JJ94 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ssna1Q9JJ94 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ssna1Q9JJ94 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ssna1Q9JJ94 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ssna1Q9JJ94 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ssna1Q9JJ94 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ssna1Q9JJ94 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ssna1Q9JJ94 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ssna1Q9JJ94 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ssna1Q9JJ94 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ssna1Q9JJ94 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ssna1Q9JJ94 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ssna1Q9JJ94 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ssna1Q9JJ94 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ssna1Q9JJ94 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ssna1Q9JJ94 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ssna1Q9JJ94 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ssna1Q9JJ94 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ssna1Q9JJ94 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ssna1Q9JJ94 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ssna1Q9JJ94 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ssna1Q9JJ94 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ssna1Q9JJ94 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ssna1Q9JJ94 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ssna1Q9JJ94 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ssna1Q9JJ94 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ssna1Q9JJ94 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ssna1Q9JJ94 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ssna1Q9JJ94 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ssna1Q9JJ94 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ssna1Q9JJ94 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ssna1Q9JJ94 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ssna1Q9JJ94 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ssna1Q9JJ94 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ssna1Q9JJ94 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ssna1Q9JJ94 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ssna1Q9JJ94 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ssna1Q9JJ94 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ssna1Q9JJ94 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ssna1Q9JJ94 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ssna1Q9JJ94 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ssna1Q9JJ94 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssna1Q9JJ94 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssna1Q9JJ94 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssna1Q9JJ94 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssna1Q9JJ94 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssna1Q9JJ94 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssna1Q9JJ94 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssna1Q9JJ94 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssna1Q9JJ94 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssna1Q9JJ94 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssna1Q9JJ94 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssna1Q9JJ94 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssna1Q9JJ94 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ssna1Q9JJ94 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ssna1Q9JJ94 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ssna1Q9JJ94 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ssna1Q9JJ94 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssna1Q9JJ94 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssna1Q9JJ94 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssna1Q9JJ94 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssna1Q9JJ94 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssna1Q9JJ94 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssna1Q9JJ94 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ssna1Q9JJ94 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ssna1Q9JJ94 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ssna1Q9JJ94 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ssna1Q9JJ94 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ssna1Q9JJ94 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ssna1Q9JJ94 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ssna1Q9JJ94 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ssna1Q9JJ94 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ssna1Q9JJ94 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ssna1Q9JJ94 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ssna1Q9JJ94 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ssna1Q9JJ94 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ssna1Q9JJ94 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ssna1Q9JJ94 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssna1Q9JJ94 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssna1Q9JJ94 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssna1Q9JJ94 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssna1Q9JJ94 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssna1Q9JJ94 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssna1Q9JJ94 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssna1Q9JJ94 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssna1Q9JJ94 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssna1Q9JJ94 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssna1Q9JJ94 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssna1Q9JJ94 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssna1Q9JJ94 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssna1Q9JJ94 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssna1Q9JJ94 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.3 ms