Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ28

Flii, Protein flightless-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FliiQ9JJ28 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FliiQ9JJ28 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FliiQ9JJ28 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FliiQ9JJ28 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FliiQ9JJ28 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FliiQ9JJ28 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FliiQ9JJ28 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FliiQ9JJ28 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FliiQ9JJ28 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FliiQ9JJ28 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FliiQ9JJ28 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FliiQ9JJ28 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FliiQ9JJ28 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FliiQ9JJ28 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FliiQ9JJ28 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FliiQ9JJ28 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FliiQ9JJ28 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FliiQ9JJ28 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FliiQ9JJ28 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FliiQ9JJ28 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FliiQ9JJ28 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FliiQ9JJ28 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FliiQ9JJ28 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FliiQ9JJ28 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FliiQ9JJ28 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FliiQ9JJ28 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FliiQ9JJ28 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FliiQ9JJ28 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FliiQ9JJ28 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FliiQ9JJ28 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FliiQ9JJ28 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FliiQ9JJ28 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FliiQ9JJ28 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FliiQ9JJ28 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FliiQ9JJ28 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FliiQ9JJ28 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
FliiQ9JJ28 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FliiQ9JJ28 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FliiQ9JJ28 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FliiQ9JJ28 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
FliiQ9JJ28 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FliiQ9JJ28 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FliiQ9JJ28 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FliiQ9JJ28 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FliiQ9JJ28 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FliiQ9JJ28 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FliiQ9JJ28 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FliiQ9JJ28 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FliiQ9JJ28 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FliiQ9JJ28 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
FliiQ9JJ28 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FliiQ9JJ28 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FliiQ9JJ28 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FliiQ9JJ28 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FliiQ9JJ28 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FliiQ9JJ28 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FliiQ9JJ28 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FliiQ9JJ28 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FliiQ9JJ28 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
FliiQ9JJ28 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FliiQ9JJ28 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FliiQ9JJ28 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FliiQ9JJ28 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FliiQ9JJ28 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FliiQ9JJ28 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FliiQ9JJ28 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
FliiQ9JJ28 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FliiQ9JJ28 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FliiQ9JJ28 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FliiQ9JJ28 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FliiQ9JJ28 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FliiQ9JJ28 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FliiQ9JJ28 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FliiQ9JJ28 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
FliiQ9JJ28 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FliiQ9JJ28 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
FliiQ9JJ28 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FliiQ9JJ28 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FliiQ9JJ28 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FliiQ9JJ28 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FliiQ9JJ28 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FliiQ9JJ28 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FliiQ9JJ28 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FliiQ9JJ28 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FliiQ9JJ28 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FliiQ9JJ28 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FliiQ9JJ28 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FliiQ9JJ28 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FliiQ9JJ28 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FliiQ9JJ28 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FliiQ9JJ28 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FliiQ9JJ28 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FliiQ9JJ28 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FliiQ9JJ28 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FliiQ9JJ28 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FliiQ9JJ28 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FliiQ9JJ28 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FliiQ9JJ28 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FliiQ9JJ28 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FliiQ9JJ28 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms