Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ush1cQ9ES64 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ush1cQ9ES64 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ush1cQ9ES64 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ush1cQ9ES64 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ush1cQ9ES64 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Ush1cQ9ES64 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ush1cQ9ES64 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ush1cQ9ES64 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ush1cQ9ES64 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ush1cQ9ES64 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ush1cQ9ES64 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ush1cQ9ES64 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ush1cQ9ES64 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Ush1cQ9ES64 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ush1cQ9ES64 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ush1cQ9ES64 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ush1cQ9ES64 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ush1cQ9ES64 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ush1cQ9ES64 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ush1cQ9ES64 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ush1cQ9ES64 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ush1cQ9ES64 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ush1cQ9ES64 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ush1cQ9ES64 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ush1cQ9ES64 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Ush1cQ9ES64 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ush1cQ9ES64 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ush1cQ9ES64 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ush1cQ9ES64 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ush1cQ9ES64 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ush1cQ9ES64 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ush1cQ9ES64 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ush1cQ9ES64 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Ush1cQ9ES64 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ush1cQ9ES64 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ush1cQ9ES64 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ush1cQ9ES64 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ush1cQ9ES64 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ush1cQ9ES64 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ush1cQ9ES64 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ush1cQ9ES64 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ush1cQ9ES64 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ush1cQ9ES64 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ush1cQ9ES64 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ush1cQ9ES64 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ush1cQ9ES64 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ush1cQ9ES64 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ush1cQ9ES64 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ush1cQ9ES64 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ush1cQ9ES64 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ush1cQ9ES64 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ush1cQ9ES64 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ush1cQ9ES64 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ush1cQ9ES64 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ush1cQ9ES64 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ush1cQ9ES64 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ush1cQ9ES64 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ush1cQ9ES64 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ush1cQ9ES64 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ush1cQ9ES64 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ush1cQ9ES64 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ush1cQ9ES64 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ush1cQ9ES64 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ush1cQ9ES64 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ush1cQ9ES64 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ush1cQ9ES64 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ush1cQ9ES64 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ush1cQ9ES64 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ush1cQ9ES64 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ush1cQ9ES64 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ush1cQ9ES64 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ush1cQ9ES64 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ush1cQ9ES64 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ush1cQ9ES64 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ush1cQ9ES64 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ush1cQ9ES64 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ush1cQ9ES64 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ush1cQ9ES64 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ush1cQ9ES64 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ush1cQ9ES64 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ush1cQ9ES64 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ush1cQ9ES64 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ush1cQ9ES64 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ush1cQ9ES64 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ush1cQ9ES64 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ush1cQ9ES64 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ush1cQ9ES64 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ush1cQ9ES64 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ush1cQ9ES64 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ush1cQ9ES64 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ush1cQ9ES64 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ush1cQ9ES64 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ush1cQ9ES64 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ush1cQ9ES64 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ush1cQ9ES64 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ush1cQ9ES64 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ush1cQ9ES64 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ush1cQ9ES64 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ush1cQ9ES64 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms