Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SelenofQ9ERR7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SelenofQ9ERR7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SelenofQ9ERR7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SelenofQ9ERR7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SelenofQ9ERR7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SelenofQ9ERR7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SelenofQ9ERR7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SelenofQ9ERR7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SelenofQ9ERR7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SelenofQ9ERR7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SelenofQ9ERR7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SelenofQ9ERR7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SelenofQ9ERR7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SelenofQ9ERR7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SelenofQ9ERR7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SelenofQ9ERR7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SelenofQ9ERR7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SelenofQ9ERR7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SelenofQ9ERR7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SelenofQ9ERR7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SelenofQ9ERR7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SelenofQ9ERR7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SelenofQ9ERR7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SelenofQ9ERR7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SelenofQ9ERR7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SelenofQ9ERR7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SelenofQ9ERR7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SelenofQ9ERR7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SelenofQ9ERR7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SelenofQ9ERR7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SelenofQ9ERR7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SelenofQ9ERR7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SelenofQ9ERR7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SelenofQ9ERR7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SelenofQ9ERR7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SelenofQ9ERR7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SelenofQ9ERR7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SelenofQ9ERR7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SelenofQ9ERR7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SelenofQ9ERR7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SelenofQ9ERR7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SelenofQ9ERR7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SelenofQ9ERR7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SelenofQ9ERR7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SelenofQ9ERR7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SelenofQ9ERR7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SelenofQ9ERR7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SelenofQ9ERR7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SelenofQ9ERR7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SelenofQ9ERR7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SelenofQ9ERR7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SelenofQ9ERR7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SelenofQ9ERR7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SelenofQ9ERR7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SelenofQ9ERR7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SelenofQ9ERR7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SelenofQ9ERR7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SelenofQ9ERR7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SelenofQ9ERR7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SelenofQ9ERR7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SelenofQ9ERR7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SelenofQ9ERR7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SelenofQ9ERR7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SelenofQ9ERR7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SelenofQ9ERR7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SelenofQ9ERR7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SelenofQ9ERR7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SelenofQ9ERR7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SelenofQ9ERR7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SelenofQ9ERR7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SelenofQ9ERR7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SelenofQ9ERR7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SelenofQ9ERR7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SelenofQ9ERR7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SelenofQ9ERR7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SelenofQ9ERR7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SelenofQ9ERR7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SelenofQ9ERR7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SelenofQ9ERR7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SelenofQ9ERR7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SelenofQ9ERR7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SelenofQ9ERR7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SelenofQ9ERR7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SelenofQ9ERR7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SelenofQ9ERR7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SelenofQ9ERR7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SelenofQ9ERR7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SelenofQ9ERR7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SelenofQ9ERR7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SelenofQ9ERR7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SelenofQ9ERR7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SelenofQ9ERR7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SelenofQ9ERR7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SelenofQ9ERR7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SelenofQ9ERR7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SelenofQ9ERR7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SelenofQ9ERR7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SelenofQ9ERR7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SelenofQ9ERR7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms