Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERE7

Mesd, LRP chaperone MESD, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MesdQ9ERE7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MesdQ9ERE7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MesdQ9ERE7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MesdQ9ERE7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MesdQ9ERE7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MesdQ9ERE7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MesdQ9ERE7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MesdQ9ERE7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MesdQ9ERE7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MesdQ9ERE7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MesdQ9ERE7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MesdQ9ERE7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MesdQ9ERE7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MesdQ9ERE7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MesdQ9ERE7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MesdQ9ERE7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MesdQ9ERE7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MesdQ9ERE7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MesdQ9ERE7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MesdQ9ERE7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MesdQ9ERE7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MesdQ9ERE7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MesdQ9ERE7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MesdQ9ERE7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MesdQ9ERE7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MesdQ9ERE7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MesdQ9ERE7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MesdQ9ERE7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MesdQ9ERE7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MesdQ9ERE7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MesdQ9ERE7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MesdQ9ERE7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MesdQ9ERE7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MesdQ9ERE7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MesdQ9ERE7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MesdQ9ERE7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MesdQ9ERE7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MesdQ9ERE7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MesdQ9ERE7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MesdQ9ERE7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MesdQ9ERE7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MesdQ9ERE7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MesdQ9ERE7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MesdQ9ERE7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MesdQ9ERE7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MesdQ9ERE7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MesdQ9ERE7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MesdQ9ERE7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MesdQ9ERE7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MesdQ9ERE7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MesdQ9ERE7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MesdQ9ERE7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MesdQ9ERE7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MesdQ9ERE7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MesdQ9ERE7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MesdQ9ERE7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MesdQ9ERE7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MesdQ9ERE7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MesdQ9ERE7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MesdQ9ERE7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MesdQ9ERE7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MesdQ9ERE7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MesdQ9ERE7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MesdQ9ERE7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MesdQ9ERE7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MesdQ9ERE7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MesdQ9ERE7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MesdQ9ERE7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MesdQ9ERE7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MesdQ9ERE7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MesdQ9ERE7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MesdQ9ERE7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MesdQ9ERE7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MesdQ9ERE7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MesdQ9ERE7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MesdQ9ERE7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MesdQ9ERE7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MesdQ9ERE7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MesdQ9ERE7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MesdQ9ERE7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MesdQ9ERE7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MesdQ9ERE7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MesdQ9ERE7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MesdQ9ERE7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MesdQ9ERE7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MesdQ9ERE7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MesdQ9ERE7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MesdQ9ERE7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MesdQ9ERE7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MesdQ9ERE7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MesdQ9ERE7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MesdQ9ERE7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MesdQ9ERE7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MesdQ9ERE7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MesdQ9ERE7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MesdQ9ERE7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MesdQ9ERE7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MesdQ9ERE7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MesdQ9ERE7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MesdQ9ERE7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
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