Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Clstn2Q9ER65 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Clstn2Q9ER65 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Clstn2Q9ER65 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Clstn2Q9ER65 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Clstn2Q9ER65 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Clstn2Q9ER65 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Clstn2Q9ER65 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Clstn2Q9ER65 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Clstn2Q9ER65 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Clstn2Q9ER65 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Clstn2Q9ER65 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Clstn2Q9ER65 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Clstn2Q9ER65 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Clstn2Q9ER65 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Clstn2Q9ER65 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Clstn2Q9ER65 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Clstn2Q9ER65 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Clstn2Q9ER65 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Clstn2Q9ER65 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Clstn2Q9ER65 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Clstn2Q9ER65 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Clstn2Q9ER65 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Clstn2Q9ER65 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Clstn2Q9ER65 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
Clstn2Q9ER65 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Clstn2Q9ER65 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
Clstn2Q9ER65 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Clstn2Q9ER65 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Clstn2Q9ER65 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Clstn2Q9ER65 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Clstn2Q9ER65 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Clstn2Q9ER65 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Clstn2Q9ER65 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Clstn2Q9ER65 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Clstn2Q9ER65 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Clstn2Q9ER65 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Clstn2Q9ER65 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Clstn2Q9ER65 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Clstn2Q9ER65 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Clstn2Q9ER65 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Clstn2Q9ER65 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Clstn2Q9ER65 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Clstn2Q9ER65 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Clstn2Q9ER65 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Clstn2Q9ER65 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Clstn2Q9ER65 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Clstn2Q9ER65 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
Clstn2Q9ER65 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Clstn2Q9ER65 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Clstn2Q9ER65 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Clstn2Q9ER65 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Clstn2Q9ER65 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Clstn2Q9ER65 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Clstn2Q9ER65 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Clstn2Q9ER65 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Clstn2Q9ER65 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
Clstn2Q9ER65 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Clstn2Q9ER65 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Clstn2Q9ER65 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Clstn2Q9ER65 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Clstn2Q9ER65 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Clstn2Q9ER65 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Clstn2Q9ER65 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Clstn2Q9ER65 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Clstn2Q9ER65 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Clstn2Q9ER65 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
Clstn2Q9ER65 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Clstn2Q9ER65 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Clstn2Q9ER65 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
Clstn2Q9ER65 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Clstn2Q9ER65 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Clstn2Q9ER65 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Clstn2Q9ER65 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Clstn2Q9ER65 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Clstn2Q9ER65 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Clstn2Q9ER65 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Clstn2Q9ER65 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Clstn2Q9ER65 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Clstn2Q9ER65 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Clstn2Q9ER65 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Clstn2Q9ER65 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Clstn2Q9ER65 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Clstn2Q9ER65 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Clstn2Q9ER65 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Clstn2Q9ER65 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Clstn2Q9ER65 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Clstn2Q9ER65 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Clstn2Q9ER65 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Clstn2Q9ER65 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Clstn2Q9ER65 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Clstn2Q9ER65 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Clstn2Q9ER65 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Clstn2Q9ER65 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Clstn2Q9ER65 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Clstn2Q9ER65 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Clstn2Q9ER65 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Clstn2Q9ER65 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Clstn2Q9ER65 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Clstn2Q9ER65 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 160.9 ms