Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ6

Rapgef4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,011 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef4Q9EQZ6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rapgef4Q9EQZ6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rapgef4Q9EQZ6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rapgef4Q9EQZ6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rapgef4Q9EQZ6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rapgef4Q9EQZ6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rapgef4Q9EQZ6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rapgef4Q9EQZ6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rapgef4Q9EQZ6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rapgef4Q9EQZ6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rapgef4Q9EQZ6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rapgef4Q9EQZ6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rapgef4Q9EQZ6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rapgef4Q9EQZ6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rapgef4Q9EQZ6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rapgef4Q9EQZ6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rapgef4Q9EQZ6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rapgef4Q9EQZ6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rapgef4Q9EQZ6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rapgef4Q9EQZ6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rapgef4Q9EQZ6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Rapgef4Q9EQZ6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rapgef4Q9EQZ6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rapgef4Q9EQZ6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rapgef4Q9EQZ6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Rapgef4Q9EQZ6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Rapgef4Q9EQZ6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rapgef4Q9EQZ6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rapgef4Q9EQZ6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rapgef4Q9EQZ6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rapgef4Q9EQZ6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rapgef4Q9EQZ6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rapgef4Q9EQZ6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rapgef4Q9EQZ6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rapgef4Q9EQZ6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rapgef4Q9EQZ6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rapgef4Q9EQZ6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rapgef4Q9EQZ6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rapgef4Q9EQZ6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rapgef4Q9EQZ6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rapgef4Q9EQZ6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rapgef4Q9EQZ6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rapgef4Q9EQZ6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rapgef4Q9EQZ6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Rapgef4Q9EQZ6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rapgef4Q9EQZ6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rapgef4Q9EQZ6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rapgef4Q9EQZ6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rapgef4Q9EQZ6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rapgef4Q9EQZ6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rapgef4Q9EQZ6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rapgef4Q9EQZ6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rapgef4Q9EQZ6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rapgef4Q9EQZ6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rapgef4Q9EQZ6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rapgef4Q9EQZ6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rapgef4Q9EQZ6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rapgef4Q9EQZ6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rapgef4Q9EQZ6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rapgef4Q9EQZ6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rapgef4Q9EQZ6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rapgef4Q9EQZ6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rapgef4Q9EQZ6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Rapgef4Q9EQZ6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rapgef4Q9EQZ6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rapgef4Q9EQZ6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rapgef4Q9EQZ6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rapgef4Q9EQZ6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rapgef4Q9EQZ6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rapgef4Q9EQZ6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Rapgef4Q9EQZ6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rapgef4Q9EQZ6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rapgef4Q9EQZ6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rapgef4Q9EQZ6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Rapgef4Q9EQZ6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rapgef4Q9EQZ6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Rapgef4Q9EQZ6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rapgef4Q9EQZ6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rapgef4Q9EQZ6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rapgef4Q9EQZ6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rapgef4Q9EQZ6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Rapgef4Q9EQZ6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rapgef4Q9EQZ6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rapgef4Q9EQZ6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Rapgef4Q9EQZ6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rapgef4Q9EQZ6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rapgef4Q9EQZ6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Rapgef4Q9EQZ6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rapgef4Q9EQZ6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rapgef4Q9EQZ6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rapgef4Q9EQZ6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rapgef4Q9EQZ6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rapgef4Q9EQZ6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rapgef4Q9EQZ6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rapgef4Q9EQZ6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
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