Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPS4

Vmn1r172, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r172Q9EPS4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r172Q9EPS4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r172Q9EPS4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r172Q9EPS4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r172Q9EPS4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r172Q9EPS4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r172Q9EPS4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r172Q9EPS4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r172Q9EPS4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r172Q9EPS4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r172Q9EPS4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r172Q9EPS4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r172Q9EPS4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r172Q9EPS4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r172Q9EPS4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r172Q9EPS4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r172Q9EPS4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r172Q9EPS4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r172Q9EPS4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r172Q9EPS4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r172Q9EPS4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r172Q9EPS4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r172Q9EPS4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r172Q9EPS4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r172Q9EPS4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r172Q9EPS4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r172Q9EPS4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r172Q9EPS4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r172Q9EPS4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r172Q9EPS4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r172Q9EPS4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r172Q9EPS4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r172Q9EPS4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r172Q9EPS4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r172Q9EPS4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r172Q9EPS4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r172Q9EPS4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r172Q9EPS4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r172Q9EPS4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r172Q9EPS4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r172Q9EPS4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r172Q9EPS4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r172Q9EPS4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r172Q9EPS4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r172Q9EPS4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r172Q9EPS4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r172Q9EPS4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r172Q9EPS4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmn1r172Q9EPS4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmn1r172Q9EPS4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmn1r172Q9EPS4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vmn1r172Q9EPS4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vmn1r172Q9EPS4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn1r172Q9EPS4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn1r172Q9EPS4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r172Q9EPS4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r172Q9EPS4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r172Q9EPS4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r172Q9EPS4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r172Q9EPS4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r172Q9EPS4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r172Q9EPS4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r172Q9EPS4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r172Q9EPS4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r172Q9EPS4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r172Q9EPS4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r172Q9EPS4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r172Q9EPS4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r172Q9EPS4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r172Q9EPS4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r172Q9EPS4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r172Q9EPS4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r172Q9EPS4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r172Q9EPS4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r172Q9EPS4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r172Q9EPS4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r172Q9EPS4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r172Q9EPS4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r172Q9EPS4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r172Q9EPS4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r172Q9EPS4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn1r172Q9EPS4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn1r172Q9EPS4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn1r172Q9EPS4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn1r172Q9EPS4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn1r172Q9EPS4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Vmn1r172Q9EPS4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vmn1r172Q9EPS4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vmn1r172Q9EPS4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r172Q9EPS4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r172Q9EPS4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r172Q9EPS4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r172Q9EPS4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r172Q9EPS4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r172Q9EPS4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vmn1r172Q9EPS4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Vmn1r172Q9EPS4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vmn1r172Q9EPS4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vmn1r172Q9EPS4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vmn1r172Q9EPS4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms