Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH2

Pop7, Ribonuclease P protein subunit p20, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop7Q9DCH2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pop7Q9DCH2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pop7Q9DCH2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pop7Q9DCH2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pop7Q9DCH2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pop7Q9DCH2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Pop7Q9DCH2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pop7Q9DCH2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pop7Q9DCH2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pop7Q9DCH2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pop7Q9DCH2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pop7Q9DCH2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pop7Q9DCH2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pop7Q9DCH2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pop7Q9DCH2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pop7Q9DCH2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Pop7Q9DCH2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pop7Q9DCH2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pop7Q9DCH2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pop7Q9DCH2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pop7Q9DCH2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pop7Q9DCH2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pop7Q9DCH2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pop7Q9DCH2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pop7Q9DCH2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pop7Q9DCH2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pop7Q9DCH2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pop7Q9DCH2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pop7Q9DCH2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Pop7Q9DCH2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pop7Q9DCH2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pop7Q9DCH2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pop7Q9DCH2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pop7Q9DCH2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pop7Q9DCH2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Pop7Q9DCH2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pop7Q9DCH2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pop7Q9DCH2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pop7Q9DCH2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pop7Q9DCH2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pop7Q9DCH2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pop7Q9DCH2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pop7Q9DCH2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pop7Q9DCH2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pop7Q9DCH2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pop7Q9DCH2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pop7Q9DCH2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Pop7Q9DCH2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pop7Q9DCH2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pop7Q9DCH2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pop7Q9DCH2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pop7Q9DCH2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pop7Q9DCH2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pop7Q9DCH2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pop7Q9DCH2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pop7Q9DCH2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pop7Q9DCH2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pop7Q9DCH2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pop7Q9DCH2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pop7Q9DCH2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pop7Q9DCH2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pop7Q9DCH2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pop7Q9DCH2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pop7Q9DCH2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pop7Q9DCH2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pop7Q9DCH2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Pop7Q9DCH2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pop7Q9DCH2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Pop7Q9DCH2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Pop7Q9DCH2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pop7Q9DCH2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pop7Q9DCH2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pop7Q9DCH2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pop7Q9DCH2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pop7Q9DCH2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pop7Q9DCH2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pop7Q9DCH2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pop7Q9DCH2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pop7Q9DCH2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pop7Q9DCH2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pop7Q9DCH2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pop7Q9DCH2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pop7Q9DCH2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pop7Q9DCH2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pop7Q9DCH2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pop7Q9DCH2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pop7Q9DCH2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pop7Q9DCH2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pop7Q9DCH2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Pop7Q9DCH2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pop7Q9DCH2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Pop7Q9DCH2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pop7Q9DCH2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Pop7Q9DCH2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pop7Q9DCH2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pop7Q9DCH2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pop7Q9DCH2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pop7Q9DCH2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pop7Q9DCH2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pop7Q9DCH2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms