Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBR4

Apbb2, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 2, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apbb2Q9DBR4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apbb2Q9DBR4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apbb2Q9DBR4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apbb2Q9DBR4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apbb2Q9DBR4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apbb2Q9DBR4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apbb2Q9DBR4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apbb2Q9DBR4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Apbb2Q9DBR4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apbb2Q9DBR4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apbb2Q9DBR4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apbb2Q9DBR4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apbb2Q9DBR4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apbb2Q9DBR4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apbb2Q9DBR4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apbb2Q9DBR4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apbb2Q9DBR4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apbb2Q9DBR4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apbb2Q9DBR4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apbb2Q9DBR4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apbb2Q9DBR4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apbb2Q9DBR4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apbb2Q9DBR4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apbb2Q9DBR4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apbb2Q9DBR4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apbb2Q9DBR4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apbb2Q9DBR4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apbb2Q9DBR4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apbb2Q9DBR4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apbb2Q9DBR4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apbb2Q9DBR4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apbb2Q9DBR4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apbb2Q9DBR4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apbb2Q9DBR4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apbb2Q9DBR4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apbb2Q9DBR4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apbb2Q9DBR4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Apbb2Q9DBR4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apbb2Q9DBR4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Apbb2Q9DBR4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apbb2Q9DBR4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apbb2Q9DBR4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apbb2Q9DBR4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apbb2Q9DBR4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apbb2Q9DBR4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apbb2Q9DBR4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apbb2Q9DBR4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apbb2Q9DBR4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apbb2Q9DBR4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apbb2Q9DBR4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apbb2Q9DBR4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apbb2Q9DBR4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apbb2Q9DBR4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apbb2Q9DBR4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apbb2Q9DBR4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apbb2Q9DBR4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apbb2Q9DBR4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apbb2Q9DBR4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apbb2Q9DBR4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Apbb2Q9DBR4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apbb2Q9DBR4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Apbb2Q9DBR4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apbb2Q9DBR4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apbb2Q9DBR4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apbb2Q9DBR4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apbb2Q9DBR4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apbb2Q9DBR4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apbb2Q9DBR4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apbb2Q9DBR4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apbb2Q9DBR4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apbb2Q9DBR4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apbb2Q9DBR4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apbb2Q9DBR4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apbb2Q9DBR4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apbb2Q9DBR4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apbb2Q9DBR4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apbb2Q9DBR4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apbb2Q9DBR4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apbb2Q9DBR4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apbb2Q9DBR4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apbb2Q9DBR4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apbb2Q9DBR4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apbb2Q9DBR4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apbb2Q9DBR4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apbb2Q9DBR4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apbb2Q9DBR4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apbb2Q9DBR4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apbb2Q9DBR4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apbb2Q9DBR4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apbb2Q9DBR4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apbb2Q9DBR4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apbb2Q9DBR4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apbb2Q9DBR4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apbb2Q9DBR4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apbb2Q9DBR4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Apbb2Q9DBR4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Apbb2Q9DBR4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Apbb2Q9DBR4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Apbb2Q9DBR4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Apbb2Q9DBR4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107 ms