Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB91

Med29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med29Q9DB91 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med29Q9DB91 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Med29Q9DB91 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med29Q9DB91 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med29Q9DB91 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med29Q9DB91 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med29Q9DB91 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med29Q9DB91 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med29Q9DB91 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med29Q9DB91 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med29Q9DB91 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med29Q9DB91 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Med29Q9DB91 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Med29Q9DB91 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Med29Q9DB91 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Med29Q9DB91 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Med29Q9DB91 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Med29Q9DB91 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Med29Q9DB91 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Med29Q9DB91 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Med29Q9DB91 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Med29Q9DB91 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Med29Q9DB91 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Med29Q9DB91 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Med29Q9DB91 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Med29Q9DB91 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Med29Q9DB91 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Med29Q9DB91 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Med29Q9DB91 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Med29Q9DB91 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Med29Q9DB91 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Med29Q9DB91 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Med29Q9DB91 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Med29Q9DB91 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Med29Q9DB91 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Med29Q9DB91 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Med29Q9DB91 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Med29Q9DB91 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Med29Q9DB91 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Med29Q9DB91 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Med29Q9DB91 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Med29Q9DB91 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Med29Q9DB91 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Med29Q9DB91 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Med29Q9DB91 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Med29Q9DB91 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Med29Q9DB91 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Med29Q9DB91 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Med29Q9DB91 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Med29Q9DB91 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Med29Q9DB91 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Med29Q9DB91 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Med29Q9DB91 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Med29Q9DB91 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Med29Q9DB91 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Med29Q9DB91 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Med29Q9DB91 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Med29Q9DB91 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Med29Q9DB91 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Med29Q9DB91 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Med29Q9DB91 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Med29Q9DB91 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Med29Q9DB91 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Med29Q9DB91 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Med29Q9DB91 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Med29Q9DB91 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Med29Q9DB91 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Med29Q9DB91 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Med29Q9DB91 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Med29Q9DB91 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Med29Q9DB91 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Med29Q9DB91 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med29Q9DB91 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med29Q9DB91 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med29Q9DB91 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med29Q9DB91 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med29Q9DB91 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Med29Q9DB91 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Med29Q9DB91 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Med29Q9DB91 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Med29Q9DB91 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Med29Q9DB91 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Med29Q9DB91 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Med29Q9DB91 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Med29Q9DB91 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Med29Q9DB91 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Med29Q9DB91 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Med29Q9DB91 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Med29Q9DB91 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Med29Q9DB91 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Med29Q9DB91 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Med29Q9DB91 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Med29Q9DB91 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Med29Q9DB91 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Med29Q9DB91 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Med29Q9DB91 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Med29Q9DB91 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Med29Q9DB91 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Med29Q9DB91 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Med29Q9DB91 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms