Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D8Q6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D8Q6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D8Q6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D8Q6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D8Q6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D8Q6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D8Q6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D8Q6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D8Q6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D8Q6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D8Q6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D8Q6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D8Q6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D8Q6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D8Q6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D8Q6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D8Q6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D8Q6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D8Q6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D8Q6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D8Q6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D8Q6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D8Q6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D8Q6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D8Q6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D8Q6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D8Q6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D8Q6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D8Q6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D8Q6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D8Q6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D8Q6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D8Q6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D8Q6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D8Q6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D8Q6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D8Q6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D8Q6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D8Q6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D8Q6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D8Q6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D8Q6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D8Q6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D8Q6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D8Q6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9D8Q6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D8Q6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D8Q6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D8Q6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D8Q6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D8Q6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D8Q6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D8Q6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D8Q6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D8Q6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D8Q6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D8Q6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D8Q6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D8Q6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D8Q6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D8Q6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D8Q6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D8Q6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D8Q6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D8Q6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D8Q6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D8Q6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D8Q6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D8Q6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D8Q6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D8Q6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D8Q6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D8Q6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D8Q6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D8Q6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D8Q6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D8Q6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D8Q6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D8Q6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D8Q6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D8Q6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D8Q6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D8Q6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D8Q6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D8Q6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D8Q6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D8Q6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9D8Q6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9D8Q6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D8Q6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D8Q6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D8Q6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D8Q6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D8Q6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D8Q6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D8Q6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D8Q6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D8Q6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D8Q6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms