Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C2

Tspan13, Tetraspanin-13, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan13Q9D8C2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan13Q9D8C2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan13Q9D8C2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan13Q9D8C2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan13Q9D8C2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan13Q9D8C2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan13Q9D8C2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan13Q9D8C2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan13Q9D8C2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan13Q9D8C2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan13Q9D8C2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan13Q9D8C2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan13Q9D8C2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan13Q9D8C2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan13Q9D8C2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan13Q9D8C2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan13Q9D8C2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan13Q9D8C2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan13Q9D8C2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan13Q9D8C2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan13Q9D8C2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan13Q9D8C2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan13Q9D8C2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan13Q9D8C2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan13Q9D8C2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan13Q9D8C2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan13Q9D8C2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan13Q9D8C2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan13Q9D8C2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan13Q9D8C2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan13Q9D8C2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan13Q9D8C2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan13Q9D8C2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan13Q9D8C2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan13Q9D8C2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan13Q9D8C2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan13Q9D8C2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan13Q9D8C2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan13Q9D8C2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan13Q9D8C2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan13Q9D8C2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan13Q9D8C2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan13Q9D8C2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan13Q9D8C2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan13Q9D8C2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan13Q9D8C2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan13Q9D8C2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan13Q9D8C2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan13Q9D8C2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan13Q9D8C2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan13Q9D8C2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan13Q9D8C2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan13Q9D8C2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan13Q9D8C2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan13Q9D8C2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan13Q9D8C2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan13Q9D8C2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan13Q9D8C2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan13Q9D8C2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan13Q9D8C2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan13Q9D8C2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan13Q9D8C2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan13Q9D8C2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan13Q9D8C2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan13Q9D8C2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan13Q9D8C2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan13Q9D8C2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tspan13Q9D8C2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tspan13Q9D8C2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tspan13Q9D8C2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspan13Q9D8C2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspan13Q9D8C2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspan13Q9D8C2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspan13Q9D8C2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspan13Q9D8C2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspan13Q9D8C2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspan13Q9D8C2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspan13Q9D8C2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspan13Q9D8C2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspan13Q9D8C2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspan13Q9D8C2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspan13Q9D8C2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspan13Q9D8C2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspan13Q9D8C2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan13Q9D8C2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan13Q9D8C2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan13Q9D8C2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan13Q9D8C2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan13Q9D8C2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan13Q9D8C2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan13Q9D8C2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan13Q9D8C2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan13Q9D8C2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan13Q9D8C2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan13Q9D8C2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan13Q9D8C2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan13Q9D8C2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan13Q9D8C2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan13Q9D8C2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan13Q9D8C2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms