Protein–RNA interactions for Protein: Q9D816

Cyp2c55, Cytochrome P450 2C55, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c55Q9D816 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyp2c55Q9D816 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyp2c55Q9D816 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyp2c55Q9D816 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyp2c55Q9D816 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyp2c55Q9D816 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyp2c55Q9D816 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyp2c55Q9D816 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyp2c55Q9D816 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyp2c55Q9D816 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyp2c55Q9D816 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cyp2c55Q9D816 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cyp2c55Q9D816 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cyp2c55Q9D816 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyp2c55Q9D816 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyp2c55Q9D816 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyp2c55Q9D816 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyp2c55Q9D816 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyp2c55Q9D816 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyp2c55Q9D816 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyp2c55Q9D816 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyp2c55Q9D816 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyp2c55Q9D816 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cyp2c55Q9D816 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cyp2c55Q9D816 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cyp2c55Q9D816 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp2c55Q9D816 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp2c55Q9D816 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp2c55Q9D816 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp2c55Q9D816 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp2c55Q9D816 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp2c55Q9D816 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp2c55Q9D816 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cyp2c55Q9D816 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyp2c55Q9D816 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyp2c55Q9D816 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyp2c55Q9D816 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyp2c55Q9D816 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyp2c55Q9D816 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyp2c55Q9D816 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyp2c55Q9D816 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp2c55Q9D816 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp2c55Q9D816 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp2c55Q9D816 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp2c55Q9D816 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp2c55Q9D816 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyp2c55Q9D816 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyp2c55Q9D816 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyp2c55Q9D816 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyp2c55Q9D816 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyp2c55Q9D816 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyp2c55Q9D816 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyp2c55Q9D816 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyp2c55Q9D816 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyp2c55Q9D816 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp2c55Q9D816 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp2c55Q9D816 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp2c55Q9D816 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp2c55Q9D816 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyp2c55Q9D816 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyp2c55Q9D816 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyp2c55Q9D816 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyp2c55Q9D816 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyp2c55Q9D816 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyp2c55Q9D816 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyp2c55Q9D816 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyp2c55Q9D816 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyp2c55Q9D816 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyp2c55Q9D816 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyp2c55Q9D816 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyp2c55Q9D816 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyp2c55Q9D816 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyp2c55Q9D816 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyp2c55Q9D816 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyp2c55Q9D816 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyp2c55Q9D816 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyp2c55Q9D816 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyp2c55Q9D816 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyp2c55Q9D816 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyp2c55Q9D816 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyp2c55Q9D816 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyp2c55Q9D816 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyp2c55Q9D816 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyp2c55Q9D816 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyp2c55Q9D816 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyp2c55Q9D816 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyp2c55Q9D816 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyp2c55Q9D816 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyp2c55Q9D816 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyp2c55Q9D816 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyp2c55Q9D816 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyp2c55Q9D816 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cyp2c55Q9D816 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cyp2c55Q9D816 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cyp2c55Q9D816 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cyp2c55Q9D816 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cyp2c55Q9D816 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cyp2c55Q9D816 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cyp2c55Q9D816 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cyp2c55Q9D816 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms