Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D7E4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D7E4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D7E4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D7E4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D7E4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D7E4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D7E4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D7E4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D7E4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D7E4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D7E4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D7E4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D7E4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D7E4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D7E4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D7E4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D7E4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D7E4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D7E4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D7E4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D7E4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D7E4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D7E4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D7E4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D7E4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D7E4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D7E4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D7E4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D7E4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9D7E4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9D7E4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9D7E4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9D7E4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9D7E4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9D7E4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Q9D7E4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D7E4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D7E4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D7E4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D7E4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D7E4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D7E4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D7E4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D7E4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D7E4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D7E4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D7E4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D7E4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D7E4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D7E4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D7E4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D7E4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D7E4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D7E4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D7E4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9D7E4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9D7E4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9D7E4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9D7E4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9D7E4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D7E4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D7E4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D7E4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D7E4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Q9D7E4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D7E4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D7E4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D7E4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D7E4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D7E4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D7E4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D7E4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D7E4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D7E4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D7E4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D7E4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D7E4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D7E4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D7E4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D7E4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D7E4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D7E4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D7E4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D7E4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D7E4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D7E4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D7E4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D7E4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D7E4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D7E4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D7E4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D7E4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D7E4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D7E4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D7E4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D7E4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D7E4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D7E4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D7E4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms