Protein–RNA interactions for Protein: Q9D711

Pir, Pirin, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PirQ9D711 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PirQ9D711 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PirQ9D711 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PirQ9D711 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PirQ9D711 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PirQ9D711 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PirQ9D711 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PirQ9D711 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PirQ9D711 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PirQ9D711 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PirQ9D711 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PirQ9D711 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PirQ9D711 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PirQ9D711 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PirQ9D711 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PirQ9D711 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PirQ9D711 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PirQ9D711 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PirQ9D711 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PirQ9D711 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PirQ9D711 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PirQ9D711 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PirQ9D711 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PirQ9D711 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PirQ9D711 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PirQ9D711 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PirQ9D711 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PirQ9D711 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PirQ9D711 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PirQ9D711 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PirQ9D711 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PirQ9D711 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PirQ9D711 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PirQ9D711 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PirQ9D711 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PirQ9D711 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PirQ9D711 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PirQ9D711 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PirQ9D711 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PirQ9D711 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PirQ9D711 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PirQ9D711 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PirQ9D711 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PirQ9D711 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PirQ9D711 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PirQ9D711 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PirQ9D711 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PirQ9D711 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PirQ9D711 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PirQ9D711 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PirQ9D711 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PirQ9D711 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PirQ9D711 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PirQ9D711 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PirQ9D711 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PirQ9D711 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PirQ9D711 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PirQ9D711 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PirQ9D711 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PirQ9D711 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PirQ9D711 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PirQ9D711 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PirQ9D711 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PirQ9D711 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PirQ9D711 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PirQ9D711 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PirQ9D711 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PirQ9D711 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PirQ9D711 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PirQ9D711 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PirQ9D711 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PirQ9D711 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PirQ9D711 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PirQ9D711 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PirQ9D711 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PirQ9D711 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PirQ9D711 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PirQ9D711 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PirQ9D711 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PirQ9D711 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PirQ9D711 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PirQ9D711 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PirQ9D711 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PirQ9D711 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PirQ9D711 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PirQ9D711 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PirQ9D711 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PirQ9D711 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PirQ9D711 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PirQ9D711 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PirQ9D711 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PirQ9D711 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PirQ9D711 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PirQ9D711 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PirQ9D711 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PirQ9D711 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PirQ9D711 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PirQ9D711 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PirQ9D711 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PirQ9D711 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms