Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rab11fip1Q9D620 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rab11fip1Q9D620 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rab11fip1Q9D620 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rab11fip1Q9D620 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rab11fip1Q9D620 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rab11fip1Q9D620 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rab11fip1Q9D620 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Rab11fip1Q9D620 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rab11fip1Q9D620 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rab11fip1Q9D620 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rab11fip1Q9D620 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rab11fip1Q9D620 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rab11fip1Q9D620 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rab11fip1Q9D620 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rab11fip1Q9D620 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rab11fip1Q9D620 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Rab11fip1Q9D620 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rab11fip1Q9D620 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Rab11fip1Q9D620 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rab11fip1Q9D620 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rab11fip1Q9D620 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab11fip1Q9D620 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab11fip1Q9D620 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab11fip1Q9D620 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab11fip1Q9D620 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab11fip1Q9D620 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab11fip1Q9D620 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab11fip1Q9D620 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rab11fip1Q9D620 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rab11fip1Q9D620 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rab11fip1Q9D620 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Rab11fip1Q9D620 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab11fip1Q9D620 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab11fip1Q9D620 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab11fip1Q9D620 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab11fip1Q9D620 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab11fip1Q9D620 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab11fip1Q9D620 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rab11fip1Q9D620 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rab11fip1Q9D620 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rab11fip1Q9D620 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rab11fip1Q9D620 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rab11fip1Q9D620 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rab11fip1Q9D620 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rab11fip1Q9D620 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rab11fip1Q9D620 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rab11fip1Q9D620 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rab11fip1Q9D620 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rab11fip1Q9D620 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rab11fip1Q9D620 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rab11fip1Q9D620 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rab11fip1Q9D620 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rab11fip1Q9D620 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rab11fip1Q9D620 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rab11fip1Q9D620 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rab11fip1Q9D620 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Rab11fip1Q9D620 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rab11fip1Q9D620 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rab11fip1Q9D620 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rab11fip1Q9D620 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rab11fip1Q9D620 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rab11fip1Q9D620 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rab11fip1Q9D620 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rab11fip1Q9D620 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rab11fip1Q9D620 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rab11fip1Q9D620 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rab11fip1Q9D620 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rab11fip1Q9D620 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rab11fip1Q9D620 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rab11fip1Q9D620 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rab11fip1Q9D620 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rab11fip1Q9D620 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Rab11fip1Q9D620 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rab11fip1Q9D620 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Rab11fip1Q9D620 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rab11fip1Q9D620 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rab11fip1Q9D620 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24■■□□□ 1.43
Rab11fip1Q9D620 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rab11fip1Q9D620 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rab11fip1Q9D620 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rab11fip1Q9D620 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Rab11fip1Q9D620 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Rab11fip1Q9D620 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rab11fip1Q9D620 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rab11fip1Q9D620 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rab11fip1Q9D620 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rab11fip1Q9D620 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rab11fip1Q9D620 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rab11fip1Q9D620 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rab11fip1Q9D620 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rab11fip1Q9D620 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rab11fip1Q9D620 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rab11fip1Q9D620 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rab11fip1Q9D620 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rab11fip1Q9D620 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rab11fip1Q9D620 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rab11fip1Q9D620 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rab11fip1Q9D620 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Rab11fip1Q9D620 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms