Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U8

Cnbd2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnbd2Q9D5U8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cnbd2Q9D5U8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cnbd2Q9D5U8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnbd2Q9D5U8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnbd2Q9D5U8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnbd2Q9D5U8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnbd2Q9D5U8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnbd2Q9D5U8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnbd2Q9D5U8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnbd2Q9D5U8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnbd2Q9D5U8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnbd2Q9D5U8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnbd2Q9D5U8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnbd2Q9D5U8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnbd2Q9D5U8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnbd2Q9D5U8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnbd2Q9D5U8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnbd2Q9D5U8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnbd2Q9D5U8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnbd2Q9D5U8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cnbd2Q9D5U8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cnbd2Q9D5U8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cnbd2Q9D5U8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cnbd2Q9D5U8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cnbd2Q9D5U8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cnbd2Q9D5U8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cnbd2Q9D5U8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cnbd2Q9D5U8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cnbd2Q9D5U8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cnbd2Q9D5U8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cnbd2Q9D5U8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cnbd2Q9D5U8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cnbd2Q9D5U8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cnbd2Q9D5U8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cnbd2Q9D5U8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cnbd2Q9D5U8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cnbd2Q9D5U8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cnbd2Q9D5U8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cnbd2Q9D5U8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cnbd2Q9D5U8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cnbd2Q9D5U8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cnbd2Q9D5U8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cnbd2Q9D5U8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cnbd2Q9D5U8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cnbd2Q9D5U8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cnbd2Q9D5U8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cnbd2Q9D5U8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cnbd2Q9D5U8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cnbd2Q9D5U8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cnbd2Q9D5U8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cnbd2Q9D5U8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cnbd2Q9D5U8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnbd2Q9D5U8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnbd2Q9D5U8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnbd2Q9D5U8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnbd2Q9D5U8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cnbd2Q9D5U8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cnbd2Q9D5U8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cnbd2Q9D5U8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cnbd2Q9D5U8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cnbd2Q9D5U8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cnbd2Q9D5U8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cnbd2Q9D5U8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cnbd2Q9D5U8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cnbd2Q9D5U8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cnbd2Q9D5U8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cnbd2Q9D5U8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cnbd2Q9D5U8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cnbd2Q9D5U8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnbd2Q9D5U8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnbd2Q9D5U8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnbd2Q9D5U8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnbd2Q9D5U8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnbd2Q9D5U8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnbd2Q9D5U8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnbd2Q9D5U8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cnbd2Q9D5U8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cnbd2Q9D5U8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cnbd2Q9D5U8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Cnbd2Q9D5U8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Cnbd2Q9D5U8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cnbd2Q9D5U8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cnbd2Q9D5U8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cnbd2Q9D5U8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnbd2Q9D5U8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnbd2Q9D5U8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnbd2Q9D5U8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnbd2Q9D5U8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnbd2Q9D5U8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cnbd2Q9D5U8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cnbd2Q9D5U8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Cnbd2Q9D5U8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cnbd2Q9D5U8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cnbd2Q9D5U8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cnbd2Q9D5U8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cnbd2Q9D5U8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cnbd2Q9D5U8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cnbd2Q9D5U8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cnbd2Q9D5U8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cnbd2Q9D5U8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms