Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PudpQ9D5U5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PudpQ9D5U5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PudpQ9D5U5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PudpQ9D5U5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PudpQ9D5U5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PudpQ9D5U5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PudpQ9D5U5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PudpQ9D5U5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PudpQ9D5U5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PudpQ9D5U5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PudpQ9D5U5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PudpQ9D5U5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PudpQ9D5U5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PudpQ9D5U5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PudpQ9D5U5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PudpQ9D5U5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PudpQ9D5U5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PudpQ9D5U5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PudpQ9D5U5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PudpQ9D5U5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PudpQ9D5U5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PudpQ9D5U5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PudpQ9D5U5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PudpQ9D5U5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PudpQ9D5U5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PudpQ9D5U5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PudpQ9D5U5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PudpQ9D5U5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PudpQ9D5U5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PudpQ9D5U5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PudpQ9D5U5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PudpQ9D5U5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PudpQ9D5U5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PudpQ9D5U5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PudpQ9D5U5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PudpQ9D5U5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PudpQ9D5U5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PudpQ9D5U5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PudpQ9D5U5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PudpQ9D5U5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PudpQ9D5U5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PudpQ9D5U5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PudpQ9D5U5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PudpQ9D5U5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PudpQ9D5U5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PudpQ9D5U5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PudpQ9D5U5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PudpQ9D5U5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PudpQ9D5U5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PudpQ9D5U5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PudpQ9D5U5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PudpQ9D5U5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PudpQ9D5U5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PudpQ9D5U5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PudpQ9D5U5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PudpQ9D5U5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PudpQ9D5U5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PudpQ9D5U5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PudpQ9D5U5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PudpQ9D5U5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PudpQ9D5U5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PudpQ9D5U5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PudpQ9D5U5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PudpQ9D5U5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PudpQ9D5U5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PudpQ9D5U5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PudpQ9D5U5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PudpQ9D5U5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PudpQ9D5U5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PudpQ9D5U5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PudpQ9D5U5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PudpQ9D5U5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PudpQ9D5U5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PudpQ9D5U5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PudpQ9D5U5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PudpQ9D5U5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PudpQ9D5U5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PudpQ9D5U5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PudpQ9D5U5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PudpQ9D5U5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PudpQ9D5U5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PudpQ9D5U5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PudpQ9D5U5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PudpQ9D5U5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PudpQ9D5U5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PudpQ9D5U5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PudpQ9D5U5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PudpQ9D5U5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PudpQ9D5U5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PudpQ9D5U5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PudpQ9D5U5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PudpQ9D5U5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PudpQ9D5U5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PudpQ9D5U5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PudpQ9D5U5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PudpQ9D5U5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PudpQ9D5U5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PudpQ9D5U5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PudpQ9D5U5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145.9 ms