Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q8

Uncharacterized protein C1orf141 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D5Q8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Q9D5Q8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Q9D5Q8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Q9D5Q8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Q9D5Q8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Q9D5Q8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Q9D5Q8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Q9D5Q8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Q9D5Q8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Q9D5Q8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Q9D5Q8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Q9D5Q8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Q9D5Q8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Q9D5Q8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Q9D5Q8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Q9D5Q8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Q9D5Q8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Q9D5Q8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Q9D5Q8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Q9D5Q8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Q9D5Q8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Q9D5Q8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Q9D5Q8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Q9D5Q8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Q9D5Q8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Q9D5Q8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Q9D5Q8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Q9D5Q8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Q9D5Q8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Q9D5Q8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Q9D5Q8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Q9D5Q8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Q9D5Q8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Q9D5Q8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Q9D5Q8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Q9D5Q8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Q9D5Q8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Q9D5Q8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Q9D5Q8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Q9D5Q8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Q9D5Q8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Q9D5Q8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Q9D5Q8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Q9D5Q8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Q9D5Q8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Q9D5Q8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Q9D5Q8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Q9D5Q8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Q9D5Q8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Q9D5Q8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Q9D5Q8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Q9D5Q8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Q9D5Q8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Q9D5Q8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Q9D5Q8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Q9D5Q8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Q9D5Q8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Q9D5Q8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Q9D5Q8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Q9D5Q8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Q9D5Q8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Q9D5Q8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Q9D5Q8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Q9D5Q8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Q9D5Q8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Q9D5Q8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Q9D5Q8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Q9D5Q8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Q9D5Q8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Q9D5Q8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Q9D5Q8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Q9D5Q8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Q9D5Q8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Q9D5Q8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Q9D5Q8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Q9D5Q8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Q9D5Q8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Q9D5Q8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Q9D5Q8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Q9D5Q8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Q9D5Q8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Q9D5Q8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Q9D5Q8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Q9D5Q8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Q9D5Q8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Q9D5Q8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Q9D5Q8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Q9D5Q8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Q9D5Q8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Q9D5Q8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Q9D5Q8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q9D5Q8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q9D5Q8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q9D5Q8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Q9D5Q8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Q9D5Q8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Q9D5Q8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Q9D5Q8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Q9D5Q8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Q9D5Q8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms