Protein–RNA interactions for Protein: Q9D518

Fam227b, Protein FAM227B, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam227bQ9D518 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam227bQ9D518 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam227bQ9D518 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam227bQ9D518 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam227bQ9D518 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam227bQ9D518 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam227bQ9D518 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam227bQ9D518 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam227bQ9D518 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam227bQ9D518 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam227bQ9D518 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam227bQ9D518 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam227bQ9D518 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam227bQ9D518 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam227bQ9D518 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam227bQ9D518 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam227bQ9D518 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam227bQ9D518 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam227bQ9D518 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Fam227bQ9D518 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam227bQ9D518 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam227bQ9D518 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam227bQ9D518 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam227bQ9D518 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam227bQ9D518 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam227bQ9D518 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam227bQ9D518 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam227bQ9D518 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam227bQ9D518 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam227bQ9D518 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam227bQ9D518 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam227bQ9D518 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam227bQ9D518 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam227bQ9D518 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam227bQ9D518 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam227bQ9D518 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam227bQ9D518 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam227bQ9D518 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam227bQ9D518 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam227bQ9D518 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam227bQ9D518 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam227bQ9D518 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam227bQ9D518 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam227bQ9D518 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam227bQ9D518 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam227bQ9D518 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam227bQ9D518 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam227bQ9D518 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam227bQ9D518 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam227bQ9D518 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam227bQ9D518 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam227bQ9D518 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam227bQ9D518 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam227bQ9D518 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam227bQ9D518 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam227bQ9D518 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam227bQ9D518 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam227bQ9D518 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam227bQ9D518 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam227bQ9D518 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam227bQ9D518 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam227bQ9D518 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam227bQ9D518 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam227bQ9D518 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam227bQ9D518 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam227bQ9D518 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam227bQ9D518 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam227bQ9D518 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam227bQ9D518 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam227bQ9D518 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam227bQ9D518 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam227bQ9D518 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam227bQ9D518 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam227bQ9D518 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam227bQ9D518 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fam227bQ9D518 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fam227bQ9D518 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam227bQ9D518 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam227bQ9D518 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam227bQ9D518 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam227bQ9D518 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam227bQ9D518 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam227bQ9D518 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam227bQ9D518 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam227bQ9D518 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam227bQ9D518 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam227bQ9D518 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam227bQ9D518 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam227bQ9D518 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam227bQ9D518 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam227bQ9D518 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam227bQ9D518 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam227bQ9D518 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam227bQ9D518 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam227bQ9D518 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam227bQ9D518 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam227bQ9D518 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam227bQ9D518 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam227bQ9D518 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam227bQ9D518 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms