Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S9

4931428L18Rik, RIKEN cDNA 4931428L18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931428L18RikQ9D4S9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
4931428L18RikQ9D4S9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4931428L18RikQ9D4S9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
4931428L18RikQ9D4S9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
4931428L18RikQ9D4S9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
4931428L18RikQ9D4S9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4931428L18RikQ9D4S9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
4931428L18RikQ9D4S9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
4931428L18RikQ9D4S9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4931428L18RikQ9D4S9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4931428L18RikQ9D4S9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
4931428L18RikQ9D4S9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4931428L18RikQ9D4S9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
4931428L18RikQ9D4S9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4931428L18RikQ9D4S9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4931428L18RikQ9D4S9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
4931428L18RikQ9D4S9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
4931428L18RikQ9D4S9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
4931428L18RikQ9D4S9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
4931428L18RikQ9D4S9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
4931428L18RikQ9D4S9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
4931428L18RikQ9D4S9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
4931428L18RikQ9D4S9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
4931428L18RikQ9D4S9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
4931428L18RikQ9D4S9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4931428L18RikQ9D4S9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4931428L18RikQ9D4S9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
4931428L18RikQ9D4S9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4931428L18RikQ9D4S9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4931428L18RikQ9D4S9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4931428L18RikQ9D4S9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
4931428L18RikQ9D4S9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4931428L18RikQ9D4S9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4931428L18RikQ9D4S9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4931428L18RikQ9D4S9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4931428L18RikQ9D4S9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4931428L18RikQ9D4S9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
4931428L18RikQ9D4S9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4931428L18RikQ9D4S9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4931428L18RikQ9D4S9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4931428L18RikQ9D4S9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4931428L18RikQ9D4S9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
4931428L18RikQ9D4S9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4931428L18RikQ9D4S9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4931428L18RikQ9D4S9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4931428L18RikQ9D4S9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4931428L18RikQ9D4S9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
4931428L18RikQ9D4S9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4931428L18RikQ9D4S9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4931428L18RikQ9D4S9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4931428L18RikQ9D4S9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4931428L18RikQ9D4S9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4931428L18RikQ9D4S9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4931428L18RikQ9D4S9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4931428L18RikQ9D4S9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
4931428L18RikQ9D4S9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
4931428L18RikQ9D4S9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
4931428L18RikQ9D4S9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
4931428L18RikQ9D4S9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
4931428L18RikQ9D4S9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
4931428L18RikQ9D4S9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
4931428L18RikQ9D4S9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
4931428L18RikQ9D4S9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
4931428L18RikQ9D4S9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
4931428L18RikQ9D4S9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
4931428L18RikQ9D4S9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
4931428L18RikQ9D4S9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
4931428L18RikQ9D4S9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
4931428L18RikQ9D4S9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
4931428L18RikQ9D4S9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
4931428L18RikQ9D4S9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
4931428L18RikQ9D4S9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
4931428L18RikQ9D4S9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
4931428L18RikQ9D4S9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
4931428L18RikQ9D4S9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
4931428L18RikQ9D4S9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
4931428L18RikQ9D4S9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
4931428L18RikQ9D4S9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
4931428L18RikQ9D4S9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
4931428L18RikQ9D4S9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
4931428L18RikQ9D4S9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
4931428L18RikQ9D4S9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
4931428L18RikQ9D4S9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
4931428L18RikQ9D4S9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
4931428L18RikQ9D4S9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
4931428L18RikQ9D4S9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
4931428L18RikQ9D4S9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
4931428L18RikQ9D4S9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
4931428L18RikQ9D4S9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
4931428L18RikQ9D4S9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
4931428L18RikQ9D4S9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
4931428L18RikQ9D4S9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
4931428L18RikQ9D4S9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
4931428L18RikQ9D4S9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
4931428L18RikQ9D4S9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
4931428L18RikQ9D4S9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
4931428L18RikQ9D4S9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms