Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Stag1Q9D3E6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Stag1Q9D3E6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Stag1Q9D3E6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Stag1Q9D3E6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Stag1Q9D3E6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Stag1Q9D3E6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Stag1Q9D3E6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Stag1Q9D3E6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Stag1Q9D3E6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Stag1Q9D3E6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Stag1Q9D3E6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Stag1Q9D3E6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Stag1Q9D3E6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Stag1Q9D3E6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Stag1Q9D3E6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Stag1Q9D3E6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Stag1Q9D3E6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Stag1Q9D3E6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Stag1Q9D3E6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Stag1Q9D3E6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Stag1Q9D3E6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Stag1Q9D3E6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Stag1Q9D3E6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Stag1Q9D3E6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Stag1Q9D3E6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Stag1Q9D3E6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Stag1Q9D3E6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Stag1Q9D3E6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Stag1Q9D3E6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Stag1Q9D3E6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Stag1Q9D3E6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Stag1Q9D3E6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Stag1Q9D3E6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Stag1Q9D3E6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Stag1Q9D3E6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Stag1Q9D3E6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Stag1Q9D3E6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Stag1Q9D3E6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Stag1Q9D3E6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Stag1Q9D3E6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Stag1Q9D3E6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Stag1Q9D3E6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Stag1Q9D3E6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Stag1Q9D3E6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Stag1Q9D3E6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Stag1Q9D3E6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Stag1Q9D3E6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Stag1Q9D3E6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Stag1Q9D3E6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Stag1Q9D3E6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Stag1Q9D3E6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Stag1Q9D3E6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Stag1Q9D3E6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Stag1Q9D3E6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Stag1Q9D3E6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Stag1Q9D3E6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Stag1Q9D3E6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Stag1Q9D3E6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Stag1Q9D3E6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Stag1Q9D3E6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Stag1Q9D3E6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Stag1Q9D3E6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Stag1Q9D3E6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Stag1Q9D3E6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Stag1Q9D3E6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Stag1Q9D3E6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Stag1Q9D3E6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Stag1Q9D3E6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Stag1Q9D3E6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Stag1Q9D3E6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Stag1Q9D3E6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Stag1Q9D3E6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Stag1Q9D3E6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Stag1Q9D3E6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Stag1Q9D3E6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Stag1Q9D3E6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Stag1Q9D3E6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Stag1Q9D3E6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Stag1Q9D3E6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Stag1Q9D3E6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Stag1Q9D3E6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Stag1Q9D3E6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Stag1Q9D3E6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Stag1Q9D3E6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Stag1Q9D3E6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Stag1Q9D3E6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Stag1Q9D3E6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Stag1Q9D3E6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Stag1Q9D3E6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Stag1Q9D3E6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Stag1Q9D3E6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Stag1Q9D3E6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Stag1Q9D3E6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Stag1Q9D3E6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Stag1Q9D3E6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Stag1Q9D3E6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Stag1Q9D3E6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Stag1Q9D3E6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Stag1Q9D3E6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms