Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chordc1Q9D1P4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chordc1Q9D1P4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chordc1Q9D1P4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chordc1Q9D1P4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chordc1Q9D1P4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Chordc1Q9D1P4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chordc1Q9D1P4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Chordc1Q9D1P4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chordc1Q9D1P4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chordc1Q9D1P4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chordc1Q9D1P4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chordc1Q9D1P4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chordc1Q9D1P4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chordc1Q9D1P4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chordc1Q9D1P4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chordc1Q9D1P4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chordc1Q9D1P4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chordc1Q9D1P4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chordc1Q9D1P4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chordc1Q9D1P4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chordc1Q9D1P4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Chordc1Q9D1P4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chordc1Q9D1P4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chordc1Q9D1P4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chordc1Q9D1P4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chordc1Q9D1P4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chordc1Q9D1P4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chordc1Q9D1P4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chordc1Q9D1P4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chordc1Q9D1P4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chordc1Q9D1P4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chordc1Q9D1P4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chordc1Q9D1P4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chordc1Q9D1P4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chordc1Q9D1P4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chordc1Q9D1P4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chordc1Q9D1P4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chordc1Q9D1P4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chordc1Q9D1P4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chordc1Q9D1P4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Chordc1Q9D1P4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chordc1Q9D1P4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chordc1Q9D1P4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chordc1Q9D1P4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chordc1Q9D1P4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chordc1Q9D1P4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chordc1Q9D1P4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chordc1Q9D1P4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chordc1Q9D1P4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chordc1Q9D1P4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Chordc1Q9D1P4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chordc1Q9D1P4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Chordc1Q9D1P4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chordc1Q9D1P4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chordc1Q9D1P4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chordc1Q9D1P4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chordc1Q9D1P4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chordc1Q9D1P4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chordc1Q9D1P4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chordc1Q9D1P4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chordc1Q9D1P4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chordc1Q9D1P4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chordc1Q9D1P4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chordc1Q9D1P4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chordc1Q9D1P4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Chordc1Q9D1P4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chordc1Q9D1P4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chordc1Q9D1P4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Chordc1Q9D1P4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chordc1Q9D1P4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chordc1Q9D1P4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chordc1Q9D1P4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chordc1Q9D1P4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chordc1Q9D1P4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chordc1Q9D1P4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chordc1Q9D1P4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chordc1Q9D1P4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chordc1Q9D1P4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chordc1Q9D1P4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chordc1Q9D1P4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chordc1Q9D1P4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chordc1Q9D1P4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Chordc1Q9D1P4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Chordc1Q9D1P4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chordc1Q9D1P4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chordc1Q9D1P4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chordc1Q9D1P4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chordc1Q9D1P4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chordc1Q9D1P4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chordc1Q9D1P4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chordc1Q9D1P4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chordc1Q9D1P4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chordc1Q9D1P4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chordc1Q9D1P4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chordc1Q9D1P4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chordc1Q9D1P4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chordc1Q9D1P4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chordc1Q9D1P4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chordc1Q9D1P4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms