Protein–RNA interactions for Protein: Q9D103

Ifitm1, Interferon-induced transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm1Q9D103 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifitm1Q9D103 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifitm1Q9D103 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifitm1Q9D103 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifitm1Q9D103 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifitm1Q9D103 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifitm1Q9D103 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifitm1Q9D103 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifitm1Q9D103 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifitm1Q9D103 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifitm1Q9D103 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifitm1Q9D103 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifitm1Q9D103 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifitm1Q9D103 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifitm1Q9D103 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifitm1Q9D103 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifitm1Q9D103 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifitm1Q9D103 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifitm1Q9D103 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifitm1Q9D103 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifitm1Q9D103 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifitm1Q9D103 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifitm1Q9D103 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifitm1Q9D103 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifitm1Q9D103 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifitm1Q9D103 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifitm1Q9D103 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifitm1Q9D103 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifitm1Q9D103 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifitm1Q9D103 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifitm1Q9D103 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifitm1Q9D103 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifitm1Q9D103 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifitm1Q9D103 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifitm1Q9D103 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifitm1Q9D103 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifitm1Q9D103 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifitm1Q9D103 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifitm1Q9D103 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifitm1Q9D103 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifitm1Q9D103 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifitm1Q9D103 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifitm1Q9D103 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifitm1Q9D103 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifitm1Q9D103 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifitm1Q9D103 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifitm1Q9D103 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifitm1Q9D103 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifitm1Q9D103 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifitm1Q9D103 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifitm1Q9D103 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifitm1Q9D103 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifitm1Q9D103 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifitm1Q9D103 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ifitm1Q9D103 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ifitm1Q9D103 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifitm1Q9D103 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifitm1Q9D103 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifitm1Q9D103 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifitm1Q9D103 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifitm1Q9D103 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifitm1Q9D103 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifitm1Q9D103 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifitm1Q9D103 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifitm1Q9D103 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifitm1Q9D103 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifitm1Q9D103 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifitm1Q9D103 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifitm1Q9D103 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifitm1Q9D103 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifitm1Q9D103 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifitm1Q9D103 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifitm1Q9D103 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifitm1Q9D103 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifitm1Q9D103 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifitm1Q9D103 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifitm1Q9D103 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifitm1Q9D103 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifitm1Q9D103 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifitm1Q9D103 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifitm1Q9D103 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifitm1Q9D103 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifitm1Q9D103 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifitm1Q9D103 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifitm1Q9D103 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifitm1Q9D103 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifitm1Q9D103 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifitm1Q9D103 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifitm1Q9D103 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifitm1Q9D103 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifitm1Q9D103 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifitm1Q9D103 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ifitm1Q9D103 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifitm1Q9D103 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifitm1Q9D103 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifitm1Q9D103 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifitm1Q9D103 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifitm1Q9D103 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifitm1Q9D103 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifitm1Q9D103 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms