Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M1

Prpsap1, Phosphoribosyl pyrophosphate synthase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpsap1Q9D0M1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prpsap1Q9D0M1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prpsap1Q9D0M1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prpsap1Q9D0M1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prpsap1Q9D0M1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prpsap1Q9D0M1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prpsap1Q9D0M1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prpsap1Q9D0M1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prpsap1Q9D0M1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prpsap1Q9D0M1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prpsap1Q9D0M1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prpsap1Q9D0M1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prpsap1Q9D0M1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prpsap1Q9D0M1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prpsap1Q9D0M1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prpsap1Q9D0M1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prpsap1Q9D0M1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prpsap1Q9D0M1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prpsap1Q9D0M1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prpsap1Q9D0M1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prpsap1Q9D0M1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prpsap1Q9D0M1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prpsap1Q9D0M1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Prpsap1Q9D0M1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prpsap1Q9D0M1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prpsap1Q9D0M1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prpsap1Q9D0M1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prpsap1Q9D0M1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prpsap1Q9D0M1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prpsap1Q9D0M1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Prpsap1Q9D0M1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Prpsap1Q9D0M1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Prpsap1Q9D0M1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prpsap1Q9D0M1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prpsap1Q9D0M1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prpsap1Q9D0M1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prpsap1Q9D0M1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prpsap1Q9D0M1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prpsap1Q9D0M1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prpsap1Q9D0M1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prpsap1Q9D0M1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prpsap1Q9D0M1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prpsap1Q9D0M1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prpsap1Q9D0M1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpsap1Q9D0M1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpsap1Q9D0M1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpsap1Q9D0M1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpsap1Q9D0M1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpsap1Q9D0M1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpsap1Q9D0M1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpsap1Q9D0M1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpsap1Q9D0M1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpsap1Q9D0M1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prpsap1Q9D0M1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prpsap1Q9D0M1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prpsap1Q9D0M1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prpsap1Q9D0M1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Prpsap1Q9D0M1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prpsap1Q9D0M1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Prpsap1Q9D0M1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prpsap1Q9D0M1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prpsap1Q9D0M1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prpsap1Q9D0M1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prpsap1Q9D0M1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prpsap1Q9D0M1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prpsap1Q9D0M1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prpsap1Q9D0M1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prpsap1Q9D0M1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prpsap1Q9D0M1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prpsap1Q9D0M1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prpsap1Q9D0M1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prpsap1Q9D0M1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prpsap1Q9D0M1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prpsap1Q9D0M1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Prpsap1Q9D0M1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Prpsap1Q9D0M1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prpsap1Q9D0M1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Prpsap1Q9D0M1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prpsap1Q9D0M1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prpsap1Q9D0M1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prpsap1Q9D0M1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prpsap1Q9D0M1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prpsap1Q9D0M1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prpsap1Q9D0M1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prpsap1Q9D0M1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prpsap1Q9D0M1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prpsap1Q9D0M1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prpsap1Q9D0M1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Prpsap1Q9D0M1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prpsap1Q9D0M1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prpsap1Q9D0M1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prpsap1Q9D0M1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prpsap1Q9D0M1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prpsap1Q9D0M1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prpsap1Q9D0M1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prpsap1Q9D0M1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prpsap1Q9D0M1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prpsap1Q9D0M1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prpsap1Q9D0M1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prpsap1Q9D0M1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms