Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mms19Q9D071 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mms19Q9D071 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mms19Q9D071 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mms19Q9D071 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mms19Q9D071 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mms19Q9D071 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mms19Q9D071 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Mms19Q9D071 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mms19Q9D071 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mms19Q9D071 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mms19Q9D071 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mms19Q9D071 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mms19Q9D071 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mms19Q9D071 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mms19Q9D071 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Mms19Q9D071 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mms19Q9D071 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mms19Q9D071 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mms19Q9D071 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mms19Q9D071 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mms19Q9D071 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Mms19Q9D071 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mms19Q9D071 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mms19Q9D071 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mms19Q9D071 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mms19Q9D071 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mms19Q9D071 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mms19Q9D071 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mms19Q9D071 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mms19Q9D071 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mms19Q9D071 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Mms19Q9D071 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Mms19Q9D071 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Mms19Q9D071 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Mms19Q9D071 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Mms19Q9D071 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mms19Q9D071 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Mms19Q9D071 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mms19Q9D071 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mms19Q9D071 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mms19Q9D071 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mms19Q9D071 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mms19Q9D071 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mms19Q9D071 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mms19Q9D071 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mms19Q9D071 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mms19Q9D071 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mms19Q9D071 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mms19Q9D071 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mms19Q9D071 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mms19Q9D071 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mms19Q9D071 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mms19Q9D071 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mms19Q9D071 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mms19Q9D071 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Mms19Q9D071 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mms19Q9D071 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mms19Q9D071 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mms19Q9D071 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mms19Q9D071 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Mms19Q9D071 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mms19Q9D071 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mms19Q9D071 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mms19Q9D071 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Mms19Q9D071 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mms19Q9D071 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mms19Q9D071 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mms19Q9D071 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mms19Q9D071 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mms19Q9D071 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mms19Q9D071 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mms19Q9D071 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mms19Q9D071 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mms19Q9D071 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mms19Q9D071 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mms19Q9D071 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mms19Q9D071 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Mms19Q9D071 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mms19Q9D071 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mms19Q9D071 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mms19Q9D071 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mms19Q9D071 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mms19Q9D071 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mms19Q9D071 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mms19Q9D071 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mms19Q9D071 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mms19Q9D071 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mms19Q9D071 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mms19Q9D071 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mms19Q9D071 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Mms19Q9D071 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mms19Q9D071 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mms19Q9D071 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mms19Q9D071 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mms19Q9D071 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mms19Q9D071 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mms19Q9D071 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mms19Q9D071 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mms19Q9D071 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.4 ms