Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ6

Mis18a, Protein Mis18-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis18aQ9CZJ6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mis18aQ9CZJ6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Mis18aQ9CZJ6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mis18aQ9CZJ6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mis18aQ9CZJ6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mis18aQ9CZJ6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mis18aQ9CZJ6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mis18aQ9CZJ6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mis18aQ9CZJ6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Mis18aQ9CZJ6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mis18aQ9CZJ6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mis18aQ9CZJ6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mis18aQ9CZJ6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mis18aQ9CZJ6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mis18aQ9CZJ6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mis18aQ9CZJ6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mis18aQ9CZJ6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mis18aQ9CZJ6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Mis18aQ9CZJ6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mis18aQ9CZJ6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mis18aQ9CZJ6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mis18aQ9CZJ6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mis18aQ9CZJ6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mis18aQ9CZJ6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Mis18aQ9CZJ6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mis18aQ9CZJ6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Mis18aQ9CZJ6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mis18aQ9CZJ6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mis18aQ9CZJ6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mis18aQ9CZJ6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mis18aQ9CZJ6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mis18aQ9CZJ6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mis18aQ9CZJ6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mis18aQ9CZJ6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mis18aQ9CZJ6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mis18aQ9CZJ6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mis18aQ9CZJ6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mis18aQ9CZJ6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mis18aQ9CZJ6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mis18aQ9CZJ6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mis18aQ9CZJ6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Mis18aQ9CZJ6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Mis18aQ9CZJ6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Mis18aQ9CZJ6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Mis18aQ9CZJ6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mis18aQ9CZJ6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mis18aQ9CZJ6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mis18aQ9CZJ6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mis18aQ9CZJ6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mis18aQ9CZJ6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mis18aQ9CZJ6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mis18aQ9CZJ6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mis18aQ9CZJ6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Mis18aQ9CZJ6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mis18aQ9CZJ6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mis18aQ9CZJ6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mis18aQ9CZJ6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mis18aQ9CZJ6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mis18aQ9CZJ6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mis18aQ9CZJ6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mis18aQ9CZJ6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mis18aQ9CZJ6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mis18aQ9CZJ6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mis18aQ9CZJ6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mis18aQ9CZJ6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Mis18aQ9CZJ6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mis18aQ9CZJ6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Mis18aQ9CZJ6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Mis18aQ9CZJ6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mis18aQ9CZJ6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mis18aQ9CZJ6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mis18aQ9CZJ6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mis18aQ9CZJ6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mis18aQ9CZJ6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Mis18aQ9CZJ6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mis18aQ9CZJ6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mis18aQ9CZJ6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mis18aQ9CZJ6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mis18aQ9CZJ6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mis18aQ9CZJ6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mis18aQ9CZJ6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mis18aQ9CZJ6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mis18aQ9CZJ6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mis18aQ9CZJ6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mis18aQ9CZJ6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mis18aQ9CZJ6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mis18aQ9CZJ6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Mis18aQ9CZJ6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mis18aQ9CZJ6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mis18aQ9CZJ6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mis18aQ9CZJ6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mis18aQ9CZJ6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Mis18aQ9CZJ6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mis18aQ9CZJ6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mis18aQ9CZJ6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mis18aQ9CZJ6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mis18aQ9CZJ6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Mis18aQ9CZJ6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mis18aQ9CZJ6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Mis18aQ9CZJ6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms