Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH3

3300002I08Rik, RIKEN cDNA 3300002I08, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3300002I08RikQ9CXH3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
3300002I08RikQ9CXH3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
3300002I08RikQ9CXH3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
3300002I08RikQ9CXH3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
3300002I08RikQ9CXH3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
3300002I08RikQ9CXH3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
3300002I08RikQ9CXH3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
3300002I08RikQ9CXH3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
3300002I08RikQ9CXH3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
3300002I08RikQ9CXH3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
3300002I08RikQ9CXH3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
3300002I08RikQ9CXH3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
3300002I08RikQ9CXH3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
3300002I08RikQ9CXH3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
3300002I08RikQ9CXH3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
3300002I08RikQ9CXH3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
3300002I08RikQ9CXH3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
3300002I08RikQ9CXH3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
3300002I08RikQ9CXH3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
3300002I08RikQ9CXH3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
3300002I08RikQ9CXH3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
3300002I08RikQ9CXH3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
3300002I08RikQ9CXH3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
3300002I08RikQ9CXH3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
3300002I08RikQ9CXH3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
3300002I08RikQ9CXH3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
3300002I08RikQ9CXH3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
3300002I08RikQ9CXH3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
3300002I08RikQ9CXH3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
3300002I08RikQ9CXH3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
3300002I08RikQ9CXH3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
3300002I08RikQ9CXH3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
3300002I08RikQ9CXH3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
3300002I08RikQ9CXH3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
3300002I08RikQ9CXH3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
3300002I08RikQ9CXH3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
3300002I08RikQ9CXH3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
3300002I08RikQ9CXH3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
3300002I08RikQ9CXH3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
3300002I08RikQ9CXH3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
3300002I08RikQ9CXH3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
3300002I08RikQ9CXH3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
3300002I08RikQ9CXH3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
3300002I08RikQ9CXH3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
3300002I08RikQ9CXH3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
3300002I08RikQ9CXH3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
3300002I08RikQ9CXH3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
3300002I08RikQ9CXH3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
3300002I08RikQ9CXH3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
3300002I08RikQ9CXH3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
3300002I08RikQ9CXH3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
3300002I08RikQ9CXH3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
3300002I08RikQ9CXH3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
3300002I08RikQ9CXH3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
3300002I08RikQ9CXH3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
3300002I08RikQ9CXH3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
3300002I08RikQ9CXH3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
3300002I08RikQ9CXH3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
3300002I08RikQ9CXH3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
3300002I08RikQ9CXH3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
3300002I08RikQ9CXH3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
3300002I08RikQ9CXH3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
3300002I08RikQ9CXH3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
3300002I08RikQ9CXH3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
3300002I08RikQ9CXH3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
3300002I08RikQ9CXH3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
3300002I08RikQ9CXH3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
3300002I08RikQ9CXH3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
3300002I08RikQ9CXH3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
3300002I08RikQ9CXH3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
3300002I08RikQ9CXH3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
3300002I08RikQ9CXH3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
3300002I08RikQ9CXH3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
3300002I08RikQ9CXH3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
3300002I08RikQ9CXH3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
3300002I08RikQ9CXH3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
3300002I08RikQ9CXH3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
3300002I08RikQ9CXH3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
3300002I08RikQ9CXH3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
3300002I08RikQ9CXH3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
3300002I08RikQ9CXH3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
3300002I08RikQ9CXH3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
3300002I08RikQ9CXH3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
3300002I08RikQ9CXH3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
3300002I08RikQ9CXH3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
3300002I08RikQ9CXH3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
3300002I08RikQ9CXH3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
3300002I08RikQ9CXH3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
3300002I08RikQ9CXH3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
3300002I08RikQ9CXH3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
3300002I08RikQ9CXH3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
3300002I08RikQ9CXH3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
3300002I08RikQ9CXH3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
3300002I08RikQ9CXH3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
3300002I08RikQ9CXH3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
3300002I08RikQ9CXH3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
3300002I08RikQ9CXH3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
3300002I08RikQ9CXH3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
3300002I08RikQ9CXH3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
3300002I08RikQ9CXH3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms