Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUH1

4930553M12Rik, RIKEN cDNA 4930553M12 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930553M12RikQ9CUH1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
4930553M12RikQ9CUH1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930553M12RikQ9CUH1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930553M12RikQ9CUH1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930553M12RikQ9CUH1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
4930553M12RikQ9CUH1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930553M12RikQ9CUH1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930553M12RikQ9CUH1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930553M12RikQ9CUH1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
4930553M12RikQ9CUH1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
4930553M12RikQ9CUH1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4930553M12RikQ9CUH1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
4930553M12RikQ9CUH1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
4930553M12RikQ9CUH1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
4930553M12RikQ9CUH1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4930553M12RikQ9CUH1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
4930553M12RikQ9CUH1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
4930553M12RikQ9CUH1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4930553M12RikQ9CUH1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4930553M12RikQ9CUH1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4930553M12RikQ9CUH1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
4930553M12RikQ9CUH1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4930553M12RikQ9CUH1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4930553M12RikQ9CUH1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
4930553M12RikQ9CUH1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4930553M12RikQ9CUH1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.29■■□□□ 1
4930553M12RikQ9CUH1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4930553M12RikQ9CUH1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4930553M12RikQ9CUH1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4930553M12RikQ9CUH1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4930553M12RikQ9CUH1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4930553M12RikQ9CUH1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930553M12RikQ9CUH1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
4930553M12RikQ9CUH1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.28■■□□□ 1
4930553M12RikQ9CUH1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
4930553M12RikQ9CUH1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930553M12RikQ9CUH1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
4930553M12RikQ9CUH1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4930553M12RikQ9CUH1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
4930553M12RikQ9CUH1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
4930553M12RikQ9CUH1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4930553M12RikQ9CUH1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930553M12RikQ9CUH1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930553M12RikQ9CUH1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930553M12RikQ9CUH1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930553M12RikQ9CUH1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930553M12RikQ9CUH1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930553M12RikQ9CUH1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930553M12RikQ9CUH1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930553M12RikQ9CUH1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930553M12RikQ9CUH1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930553M12RikQ9CUH1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930553M12RikQ9CUH1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930553M12RikQ9CUH1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930553M12RikQ9CUH1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930553M12RikQ9CUH1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
4930553M12RikQ9CUH1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930553M12RikQ9CUH1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930553M12RikQ9CUH1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930553M12RikQ9CUH1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930553M12RikQ9CUH1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930553M12RikQ9CUH1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930553M12RikQ9CUH1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930553M12RikQ9CUH1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930553M12RikQ9CUH1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930553M12RikQ9CUH1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930553M12RikQ9CUH1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930553M12RikQ9CUH1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
4930553M12RikQ9CUH1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
4930553M12RikQ9CUH1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
4930553M12RikQ9CUH1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4930553M12RikQ9CUH1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
4930553M12RikQ9CUH1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4930553M12RikQ9CUH1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4930553M12RikQ9CUH1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
4930553M12RikQ9CUH1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
4930553M12RikQ9CUH1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
4930553M12RikQ9CUH1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
4930553M12RikQ9CUH1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
4930553M12RikQ9CUH1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
4930553M12RikQ9CUH1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
4930553M12RikQ9CUH1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930553M12RikQ9CUH1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930553M12RikQ9CUH1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930553M12RikQ9CUH1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930553M12RikQ9CUH1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4930553M12RikQ9CUH1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
4930553M12RikQ9CUH1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4930553M12RikQ9CUH1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
4930553M12RikQ9CUH1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
4930553M12RikQ9CUH1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4930553M12RikQ9CUH1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4930553M12RikQ9CUH1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4930553M12RikQ9CUH1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
4930553M12RikQ9CUH1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
4930553M12RikQ9CUH1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms