Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sft2d3Q9CSV6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Sft2d3Q9CSV6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Sft2d3Q9CSV6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sft2d3Q9CSV6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sft2d3Q9CSV6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sft2d3Q9CSV6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sft2d3Q9CSV6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sft2d3Q9CSV6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sft2d3Q9CSV6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sft2d3Q9CSV6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sft2d3Q9CSV6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sft2d3Q9CSV6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sft2d3Q9CSV6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sft2d3Q9CSV6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sft2d3Q9CSV6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sft2d3Q9CSV6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sft2d3Q9CSV6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sft2d3Q9CSV6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sft2d3Q9CSV6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sft2d3Q9CSV6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sft2d3Q9CSV6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Sft2d3Q9CSV6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sft2d3Q9CSV6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sft2d3Q9CSV6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sft2d3Q9CSV6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sft2d3Q9CSV6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sft2d3Q9CSV6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sft2d3Q9CSV6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sft2d3Q9CSV6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sft2d3Q9CSV6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sft2d3Q9CSV6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sft2d3Q9CSV6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sft2d3Q9CSV6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sft2d3Q9CSV6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sft2d3Q9CSV6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sft2d3Q9CSV6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sft2d3Q9CSV6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sft2d3Q9CSV6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sft2d3Q9CSV6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sft2d3Q9CSV6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sft2d3Q9CSV6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sft2d3Q9CSV6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sft2d3Q9CSV6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sft2d3Q9CSV6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Sft2d3Q9CSV6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sft2d3Q9CSV6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sft2d3Q9CSV6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sft2d3Q9CSV6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Sft2d3Q9CSV6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sft2d3Q9CSV6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sft2d3Q9CSV6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sft2d3Q9CSV6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sft2d3Q9CSV6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sft2d3Q9CSV6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Sft2d3Q9CSV6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sft2d3Q9CSV6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sft2d3Q9CSV6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sft2d3Q9CSV6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sft2d3Q9CSV6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sft2d3Q9CSV6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Sft2d3Q9CSV6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Sft2d3Q9CSV6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sft2d3Q9CSV6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Sft2d3Q9CSV6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sft2d3Q9CSV6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sft2d3Q9CSV6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sft2d3Q9CSV6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sft2d3Q9CSV6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sft2d3Q9CSV6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sft2d3Q9CSV6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sft2d3Q9CSV6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sft2d3Q9CSV6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sft2d3Q9CSV6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sft2d3Q9CSV6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sft2d3Q9CSV6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sft2d3Q9CSV6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sft2d3Q9CSV6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sft2d3Q9CSV6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sft2d3Q9CSV6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sft2d3Q9CSV6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sft2d3Q9CSV6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sft2d3Q9CSV6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sft2d3Q9CSV6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sft2d3Q9CSV6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sft2d3Q9CSV6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sft2d3Q9CSV6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sft2d3Q9CSV6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sft2d3Q9CSV6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sft2d3Q9CSV6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sft2d3Q9CSV6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sft2d3Q9CSV6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sft2d3Q9CSV6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sft2d3Q9CSV6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Sft2d3Q9CSV6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Sft2d3Q9CSV6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sft2d3Q9CSV6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sft2d3Q9CSV6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sft2d3Q9CSV6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sft2d3Q9CSV6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms