Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRB4

1700029F12Rik, RIKEN cDNA 1700029F12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029F12RikQ9CRB4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700029F12RikQ9CRB4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700029F12RikQ9CRB4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700029F12RikQ9CRB4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700029F12RikQ9CRB4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700029F12RikQ9CRB4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700029F12RikQ9CRB4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700029F12RikQ9CRB4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700029F12RikQ9CRB4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700029F12RikQ9CRB4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
1700029F12RikQ9CRB4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
1700029F12RikQ9CRB4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700029F12RikQ9CRB4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700029F12RikQ9CRB4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700029F12RikQ9CRB4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700029F12RikQ9CRB4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700029F12RikQ9CRB4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700029F12RikQ9CRB4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700029F12RikQ9CRB4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700029F12RikQ9CRB4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700029F12RikQ9CRB4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700029F12RikQ9CRB4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700029F12RikQ9CRB4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700029F12RikQ9CRB4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700029F12RikQ9CRB4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700029F12RikQ9CRB4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700029F12RikQ9CRB4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700029F12RikQ9CRB4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700029F12RikQ9CRB4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700029F12RikQ9CRB4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700029F12RikQ9CRB4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700029F12RikQ9CRB4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700029F12RikQ9CRB4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700029F12RikQ9CRB4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700029F12RikQ9CRB4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700029F12RikQ9CRB4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700029F12RikQ9CRB4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
1700029F12RikQ9CRB4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700029F12RikQ9CRB4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700029F12RikQ9CRB4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700029F12RikQ9CRB4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700029F12RikQ9CRB4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700029F12RikQ9CRB4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700029F12RikQ9CRB4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700029F12RikQ9CRB4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700029F12RikQ9CRB4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700029F12RikQ9CRB4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700029F12RikQ9CRB4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
1700029F12RikQ9CRB4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700029F12RikQ9CRB4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700029F12RikQ9CRB4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
1700029F12RikQ9CRB4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700029F12RikQ9CRB4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700029F12RikQ9CRB4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700029F12RikQ9CRB4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700029F12RikQ9CRB4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700029F12RikQ9CRB4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700029F12RikQ9CRB4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700029F12RikQ9CRB4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700029F12RikQ9CRB4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700029F12RikQ9CRB4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700029F12RikQ9CRB4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700029F12RikQ9CRB4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700029F12RikQ9CRB4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700029F12RikQ9CRB4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700029F12RikQ9CRB4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700029F12RikQ9CRB4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700029F12RikQ9CRB4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
1700029F12RikQ9CRB4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700029F12RikQ9CRB4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700029F12RikQ9CRB4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700029F12RikQ9CRB4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700029F12RikQ9CRB4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700029F12RikQ9CRB4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700029F12RikQ9CRB4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
1700029F12RikQ9CRB4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
1700029F12RikQ9CRB4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
1700029F12RikQ9CRB4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
1700029F12RikQ9CRB4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700029F12RikQ9CRB4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
1700029F12RikQ9CRB4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700029F12RikQ9CRB4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700029F12RikQ9CRB4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700029F12RikQ9CRB4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
1700029F12RikQ9CRB4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700029F12RikQ9CRB4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700029F12RikQ9CRB4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700029F12RikQ9CRB4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700029F12RikQ9CRB4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700029F12RikQ9CRB4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700029F12RikQ9CRB4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700029F12RikQ9CRB4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700029F12RikQ9CRB4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700029F12RikQ9CRB4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700029F12RikQ9CRB4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700029F12RikQ9CRB4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700029F12RikQ9CRB4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700029F12RikQ9CRB4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700029F12RikQ9CRB4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700029F12RikQ9CRB4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 178 ms