Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA4

Msmo1, Methylsterol monooxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msmo1Q9CRA4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Msmo1Q9CRA4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Msmo1Q9CRA4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Msmo1Q9CRA4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Msmo1Q9CRA4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Msmo1Q9CRA4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Msmo1Q9CRA4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Msmo1Q9CRA4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Msmo1Q9CRA4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Msmo1Q9CRA4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Msmo1Q9CRA4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Msmo1Q9CRA4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Msmo1Q9CRA4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Msmo1Q9CRA4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Msmo1Q9CRA4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Msmo1Q9CRA4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Msmo1Q9CRA4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Msmo1Q9CRA4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Msmo1Q9CRA4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Msmo1Q9CRA4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Msmo1Q9CRA4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Msmo1Q9CRA4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Msmo1Q9CRA4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Msmo1Q9CRA4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Msmo1Q9CRA4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Msmo1Q9CRA4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Msmo1Q9CRA4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Msmo1Q9CRA4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Msmo1Q9CRA4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Msmo1Q9CRA4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Msmo1Q9CRA4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Msmo1Q9CRA4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Msmo1Q9CRA4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Msmo1Q9CRA4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Msmo1Q9CRA4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Msmo1Q9CRA4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Msmo1Q9CRA4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Msmo1Q9CRA4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Msmo1Q9CRA4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Msmo1Q9CRA4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Msmo1Q9CRA4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Msmo1Q9CRA4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Msmo1Q9CRA4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Msmo1Q9CRA4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Msmo1Q9CRA4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Msmo1Q9CRA4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Msmo1Q9CRA4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Msmo1Q9CRA4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Msmo1Q9CRA4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Msmo1Q9CRA4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Msmo1Q9CRA4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Msmo1Q9CRA4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Msmo1Q9CRA4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Msmo1Q9CRA4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Msmo1Q9CRA4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Msmo1Q9CRA4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Msmo1Q9CRA4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Msmo1Q9CRA4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Msmo1Q9CRA4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Msmo1Q9CRA4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Msmo1Q9CRA4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Msmo1Q9CRA4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Msmo1Q9CRA4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Msmo1Q9CRA4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Msmo1Q9CRA4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Msmo1Q9CRA4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Msmo1Q9CRA4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Msmo1Q9CRA4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Msmo1Q9CRA4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Msmo1Q9CRA4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Msmo1Q9CRA4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Msmo1Q9CRA4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Msmo1Q9CRA4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Msmo1Q9CRA4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Msmo1Q9CRA4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Msmo1Q9CRA4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Msmo1Q9CRA4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Msmo1Q9CRA4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Msmo1Q9CRA4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Msmo1Q9CRA4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Msmo1Q9CRA4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Msmo1Q9CRA4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Msmo1Q9CRA4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Msmo1Q9CRA4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Msmo1Q9CRA4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Msmo1Q9CRA4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Msmo1Q9CRA4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Msmo1Q9CRA4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Msmo1Q9CRA4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Msmo1Q9CRA4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Msmo1Q9CRA4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Msmo1Q9CRA4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Msmo1Q9CRA4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Msmo1Q9CRA4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Msmo1Q9CRA4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Msmo1Q9CRA4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Msmo1Q9CRA4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Msmo1Q9CRA4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Msmo1Q9CRA4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Msmo1Q9CRA4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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