Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX0

Otub2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otub2Q9CQX0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Otub2Q9CQX0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Otub2Q9CQX0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Otub2Q9CQX0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Otub2Q9CQX0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Otub2Q9CQX0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Otub2Q9CQX0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Otub2Q9CQX0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Otub2Q9CQX0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Otub2Q9CQX0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Otub2Q9CQX0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Otub2Q9CQX0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Otub2Q9CQX0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Otub2Q9CQX0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Otub2Q9CQX0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Otub2Q9CQX0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Otub2Q9CQX0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Otub2Q9CQX0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Otub2Q9CQX0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Otub2Q9CQX0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Otub2Q9CQX0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Otub2Q9CQX0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Otub2Q9CQX0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Otub2Q9CQX0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Otub2Q9CQX0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Otub2Q9CQX0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Otub2Q9CQX0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Otub2Q9CQX0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Otub2Q9CQX0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Otub2Q9CQX0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Otub2Q9CQX0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Otub2Q9CQX0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Otub2Q9CQX0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Otub2Q9CQX0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Otub2Q9CQX0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Otub2Q9CQX0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Otub2Q9CQX0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Otub2Q9CQX0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Otub2Q9CQX0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Otub2Q9CQX0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Otub2Q9CQX0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Otub2Q9CQX0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Otub2Q9CQX0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Otub2Q9CQX0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Otub2Q9CQX0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Otub2Q9CQX0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Otub2Q9CQX0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Otub2Q9CQX0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Otub2Q9CQX0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Otub2Q9CQX0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Otub2Q9CQX0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Otub2Q9CQX0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Otub2Q9CQX0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Otub2Q9CQX0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Otub2Q9CQX0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Otub2Q9CQX0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Otub2Q9CQX0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Otub2Q9CQX0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Otub2Q9CQX0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Otub2Q9CQX0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Otub2Q9CQX0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Otub2Q9CQX0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Otub2Q9CQX0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Otub2Q9CQX0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Otub2Q9CQX0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Otub2Q9CQX0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Otub2Q9CQX0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Otub2Q9CQX0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Otub2Q9CQX0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Otub2Q9CQX0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Otub2Q9CQX0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Otub2Q9CQX0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Otub2Q9CQX0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Otub2Q9CQX0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Otub2Q9CQX0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Otub2Q9CQX0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Otub2Q9CQX0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Otub2Q9CQX0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Otub2Q9CQX0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Otub2Q9CQX0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Otub2Q9CQX0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Otub2Q9CQX0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Otub2Q9CQX0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Otub2Q9CQX0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Otub2Q9CQX0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Otub2Q9CQX0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Otub2Q9CQX0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Otub2Q9CQX0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Otub2Q9CQX0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Otub2Q9CQX0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Otub2Q9CQX0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Otub2Q9CQX0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Otub2Q9CQX0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Otub2Q9CQX0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Otub2Q9CQX0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Otub2Q9CQX0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Otub2Q9CQX0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Otub2Q9CQX0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Otub2Q9CQX0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Otub2Q9CQX0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms