Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQN1

Trap1, Heat shock protein 75 kDa, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trap1Q9CQN1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trap1Q9CQN1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trap1Q9CQN1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Trap1Q9CQN1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Trap1Q9CQN1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trap1Q9CQN1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trap1Q9CQN1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trap1Q9CQN1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trap1Q9CQN1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trap1Q9CQN1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trap1Q9CQN1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trap1Q9CQN1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trap1Q9CQN1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trap1Q9CQN1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trap1Q9CQN1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trap1Q9CQN1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Trap1Q9CQN1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trap1Q9CQN1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trap1Q9CQN1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trap1Q9CQN1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trap1Q9CQN1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trap1Q9CQN1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Trap1Q9CQN1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trap1Q9CQN1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trap1Q9CQN1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trap1Q9CQN1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trap1Q9CQN1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trap1Q9CQN1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trap1Q9CQN1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trap1Q9CQN1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Trap1Q9CQN1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trap1Q9CQN1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trap1Q9CQN1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trap1Q9CQN1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trap1Q9CQN1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trap1Q9CQN1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trap1Q9CQN1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trap1Q9CQN1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trap1Q9CQN1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trap1Q9CQN1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trap1Q9CQN1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Trap1Q9CQN1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trap1Q9CQN1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trap1Q9CQN1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trap1Q9CQN1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Trap1Q9CQN1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trap1Q9CQN1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trap1Q9CQN1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trap1Q9CQN1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trap1Q9CQN1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trap1Q9CQN1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trap1Q9CQN1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Trap1Q9CQN1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trap1Q9CQN1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Trap1Q9CQN1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trap1Q9CQN1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trap1Q9CQN1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trap1Q9CQN1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trap1Q9CQN1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trap1Q9CQN1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trap1Q9CQN1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trap1Q9CQN1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trap1Q9CQN1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trap1Q9CQN1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trap1Q9CQN1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trap1Q9CQN1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trap1Q9CQN1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trap1Q9CQN1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trap1Q9CQN1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trap1Q9CQN1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trap1Q9CQN1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trap1Q9CQN1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trap1Q9CQN1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trap1Q9CQN1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trap1Q9CQN1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trap1Q9CQN1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trap1Q9CQN1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trap1Q9CQN1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trap1Q9CQN1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trap1Q9CQN1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trap1Q9CQN1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trap1Q9CQN1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trap1Q9CQN1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trap1Q9CQN1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trap1Q9CQN1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trap1Q9CQN1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trap1Q9CQN1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trap1Q9CQN1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trap1Q9CQN1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trap1Q9CQN1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trap1Q9CQN1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trap1Q9CQN1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trap1Q9CQN1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trap1Q9CQN1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trap1Q9CQN1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trap1Q9CQN1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trap1Q9CQN1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trap1Q9CQN1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trap1Q9CQN1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trap1Q9CQN1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms