Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG9

Tmem100, Transmembrane protein 100, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem100Q9CQG9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem100Q9CQG9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem100Q9CQG9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem100Q9CQG9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem100Q9CQG9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem100Q9CQG9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmem100Q9CQG9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem100Q9CQG9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem100Q9CQG9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem100Q9CQG9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem100Q9CQG9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem100Q9CQG9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem100Q9CQG9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem100Q9CQG9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem100Q9CQG9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem100Q9CQG9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem100Q9CQG9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem100Q9CQG9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem100Q9CQG9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem100Q9CQG9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem100Q9CQG9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem100Q9CQG9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem100Q9CQG9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem100Q9CQG9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem100Q9CQG9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem100Q9CQG9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem100Q9CQG9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem100Q9CQG9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem100Q9CQG9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem100Q9CQG9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem100Q9CQG9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem100Q9CQG9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem100Q9CQG9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem100Q9CQG9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem100Q9CQG9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem100Q9CQG9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem100Q9CQG9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem100Q9CQG9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem100Q9CQG9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem100Q9CQG9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem100Q9CQG9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem100Q9CQG9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem100Q9CQG9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem100Q9CQG9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem100Q9CQG9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem100Q9CQG9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem100Q9CQG9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem100Q9CQG9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem100Q9CQG9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem100Q9CQG9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem100Q9CQG9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem100Q9CQG9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem100Q9CQG9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem100Q9CQG9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem100Q9CQG9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem100Q9CQG9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem100Q9CQG9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem100Q9CQG9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem100Q9CQG9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem100Q9CQG9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem100Q9CQG9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem100Q9CQG9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem100Q9CQG9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem100Q9CQG9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem100Q9CQG9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem100Q9CQG9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem100Q9CQG9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem100Q9CQG9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem100Q9CQG9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem100Q9CQG9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem100Q9CQG9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem100Q9CQG9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem100Q9CQG9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem100Q9CQG9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem100Q9CQG9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem100Q9CQG9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem100Q9CQG9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem100Q9CQG9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem100Q9CQG9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem100Q9CQG9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tmem100Q9CQG9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tmem100Q9CQG9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tmem100Q9CQG9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tmem100Q9CQG9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tmem100Q9CQG9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem100Q9CQG9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem100Q9CQG9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem100Q9CQG9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem100Q9CQG9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem100Q9CQG9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem100Q9CQG9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem100Q9CQG9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem100Q9CQG9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem100Q9CQG9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem100Q9CQG9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem100Q9CQG9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem100Q9CQG9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem100Q9CQG9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem100Q9CQG9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem100Q9CQG9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms