Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ36

Pole4, DNA polymerase epsilon subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole4Q9CQ36 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pole4Q9CQ36 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Pole4Q9CQ36 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pole4Q9CQ36 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pole4Q9CQ36 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pole4Q9CQ36 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pole4Q9CQ36 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pole4Q9CQ36 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pole4Q9CQ36 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pole4Q9CQ36 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pole4Q9CQ36 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pole4Q9CQ36 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pole4Q9CQ36 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pole4Q9CQ36 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pole4Q9CQ36 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pole4Q9CQ36 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pole4Q9CQ36 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pole4Q9CQ36 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Pole4Q9CQ36 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pole4Q9CQ36 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pole4Q9CQ36 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pole4Q9CQ36 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pole4Q9CQ36 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pole4Q9CQ36 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pole4Q9CQ36 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pole4Q9CQ36 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pole4Q9CQ36 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pole4Q9CQ36 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pole4Q9CQ36 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pole4Q9CQ36 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pole4Q9CQ36 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pole4Q9CQ36 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pole4Q9CQ36 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pole4Q9CQ36 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pole4Q9CQ36 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pole4Q9CQ36 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pole4Q9CQ36 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pole4Q9CQ36 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pole4Q9CQ36 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pole4Q9CQ36 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pole4Q9CQ36 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pole4Q9CQ36 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pole4Q9CQ36 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pole4Q9CQ36 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Pole4Q9CQ36 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pole4Q9CQ36 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pole4Q9CQ36 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pole4Q9CQ36 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pole4Q9CQ36 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pole4Q9CQ36 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pole4Q9CQ36 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pole4Q9CQ36 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pole4Q9CQ36 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pole4Q9CQ36 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pole4Q9CQ36 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pole4Q9CQ36 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pole4Q9CQ36 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pole4Q9CQ36 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pole4Q9CQ36 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pole4Q9CQ36 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pole4Q9CQ36 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pole4Q9CQ36 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pole4Q9CQ36 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pole4Q9CQ36 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pole4Q9CQ36 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pole4Q9CQ36 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pole4Q9CQ36 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pole4Q9CQ36 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pole4Q9CQ36 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pole4Q9CQ36 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pole4Q9CQ36 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pole4Q9CQ36 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pole4Q9CQ36 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pole4Q9CQ36 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pole4Q9CQ36 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pole4Q9CQ36 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pole4Q9CQ36 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pole4Q9CQ36 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pole4Q9CQ36 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pole4Q9CQ36 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pole4Q9CQ36 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pole4Q9CQ36 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pole4Q9CQ36 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Pole4Q9CQ36 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pole4Q9CQ36 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pole4Q9CQ36 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pole4Q9CQ36 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pole4Q9CQ36 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pole4Q9CQ36 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pole4Q9CQ36 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pole4Q9CQ36 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pole4Q9CQ36 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pole4Q9CQ36 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pole4Q9CQ36 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pole4Q9CQ36 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pole4Q9CQ36 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pole4Q9CQ36 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pole4Q9CQ36 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pole4Q9CQ36 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pole4Q9CQ36 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 204.5 ms