Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPY4

Cdk2ap2, Cyclin-dependent kinase 2-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk2ap2Q9CPY4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdk2ap2Q9CPY4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdk2ap2Q9CPY4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdk2ap2Q9CPY4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdk2ap2Q9CPY4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdk2ap2Q9CPY4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdk2ap2Q9CPY4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdk2ap2Q9CPY4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdk2ap2Q9CPY4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdk2ap2Q9CPY4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdk2ap2Q9CPY4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdk2ap2Q9CPY4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdk2ap2Q9CPY4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cdk2ap2Q9CPY4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cdk2ap2Q9CPY4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk2ap2Q9CPY4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk2ap2Q9CPY4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk2ap2Q9CPY4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk2ap2Q9CPY4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk2ap2Q9CPY4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk2ap2Q9CPY4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk2ap2Q9CPY4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk2ap2Q9CPY4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk2ap2Q9CPY4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk2ap2Q9CPY4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk2ap2Q9CPY4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk2ap2Q9CPY4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk2ap2Q9CPY4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk2ap2Q9CPY4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk2ap2Q9CPY4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk2ap2Q9CPY4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk2ap2Q9CPY4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk2ap2Q9CPY4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk2ap2Q9CPY4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk2ap2Q9CPY4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk2ap2Q9CPY4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk2ap2Q9CPY4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk2ap2Q9CPY4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk2ap2Q9CPY4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk2ap2Q9CPY4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk2ap2Q9CPY4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk2ap2Q9CPY4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk2ap2Q9CPY4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk2ap2Q9CPY4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk2ap2Q9CPY4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk2ap2Q9CPY4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk2ap2Q9CPY4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk2ap2Q9CPY4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk2ap2Q9CPY4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk2ap2Q9CPY4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk2ap2Q9CPY4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk2ap2Q9CPY4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk2ap2Q9CPY4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk2ap2Q9CPY4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk2ap2Q9CPY4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk2ap2Q9CPY4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk2ap2Q9CPY4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk2ap2Q9CPY4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk2ap2Q9CPY4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk2ap2Q9CPY4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk2ap2Q9CPY4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk2ap2Q9CPY4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk2ap2Q9CPY4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk2ap2Q9CPY4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk2ap2Q9CPY4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk2ap2Q9CPY4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk2ap2Q9CPY4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk2ap2Q9CPY4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk2ap2Q9CPY4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdk2ap2Q9CPY4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdk2ap2Q9CPY4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdk2ap2Q9CPY4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk2ap2Q9CPY4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk2ap2Q9CPY4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk2ap2Q9CPY4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk2ap2Q9CPY4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk2ap2Q9CPY4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk2ap2Q9CPY4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk2ap2Q9CPY4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk2ap2Q9CPY4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk2ap2Q9CPY4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk2ap2Q9CPY4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk2ap2Q9CPY4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk2ap2Q9CPY4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk2ap2Q9CPY4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk2ap2Q9CPY4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk2ap2Q9CPY4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk2ap2Q9CPY4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk2ap2Q9CPY4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk2ap2Q9CPY4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk2ap2Q9CPY4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk2ap2Q9CPY4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk2ap2Q9CPY4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk2ap2Q9CPY4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk2ap2Q9CPY4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk2ap2Q9CPY4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk2ap2Q9CPY4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk2ap2Q9CPY4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk2ap2Q9CPY4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk2ap2Q9CPY4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms