Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
Rrbp1Q99PL5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Rrbp1Q99PL5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Rrbp1Q99PL5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Rrbp1Q99PL5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Rrbp1Q99PL5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
Rrbp1Q99PL5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Rrbp1Q99PL5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Rrbp1Q99PL5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Rrbp1Q99PL5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Rrbp1Q99PL5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
Rrbp1Q99PL5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Rrbp1Q99PL5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Rrbp1Q99PL5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Rrbp1Q99PL5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Rrbp1Q99PL5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Rrbp1Q99PL5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Rrbp1Q99PL5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Rrbp1Q99PL5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Rrbp1Q99PL5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.7■■■■□ 3.31
Rrbp1Q99PL5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.3
Rrbp1Q99PL5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.3
Rrbp1Q99PL5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Rrbp1Q99PL5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Rrbp1Q99PL5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Rrbp1Q99PL5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Rrbp1Q99PL5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Rrbp1Q99PL5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Rrbp1Q99PL5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Rrbp1Q99PL5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Rrbp1Q99PL5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
Rrbp1Q99PL5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Rrbp1Q99PL5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Rrbp1Q99PL5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Rrbp1Q99PL5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Rrbp1Q99PL5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Rrbp1Q99PL5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Rrbp1Q99PL5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
Rrbp1Q99PL5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Rrbp1Q99PL5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Rrbp1Q99PL5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Rrbp1Q99PL5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Rrbp1Q99PL5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Rrbp1Q99PL5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Rrbp1Q99PL5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
Rrbp1Q99PL5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
Rrbp1Q99PL5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
Rrbp1Q99PL5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.29
Rrbp1Q99PL5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
Rrbp1Q99PL5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Rrbp1Q99PL5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Rrbp1Q99PL5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Rrbp1Q99PL5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Rrbp1Q99PL5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Rrbp1Q99PL5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Rrbp1Q99PL5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Rrbp1Q99PL5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Rrbp1Q99PL5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Rrbp1Q99PL5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Rrbp1Q99PL5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Rrbp1Q99PL5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Rrbp1Q99PL5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Rrbp1Q99PL5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Rrbp1Q99PL5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
Rrbp1Q99PL5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Rrbp1Q99PL5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Rrbp1Q99PL5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Rrbp1Q99PL5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
Rrbp1Q99PL5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Rrbp1Q99PL5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Rrbp1Q99PL5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Rrbp1Q99PL5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Rrbp1Q99PL5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Rrbp1Q99PL5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Rrbp1Q99PL5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Rrbp1Q99PL5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Rrbp1Q99PL5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Rrbp1Q99PL5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Rrbp1Q99PL5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Rrbp1Q99PL5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Rrbp1Q99PL5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Rrbp1Q99PL5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Rrbp1Q99PL5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
Rrbp1Q99PL5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Rrbp1Q99PL5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Rrbp1Q99PL5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Rrbp1Q99PL5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Rrbp1Q99PL5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Rrbp1Q99PL5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Rrbp1Q99PL5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Rrbp1Q99PL5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
Rrbp1Q99PL5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Rrbp1Q99PL5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Rrbp1Q99PL5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Rrbp1Q99PL5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Rrbp1Q99PL5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Rrbp1Q99PL5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Rrbp1Q99PL5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Rrbp1Q99PL5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Rrbp1Q99PL5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.4 ms