Protein–RNA interactions for Protein: Q99P47

Cntnap4, Contactin-associated protein-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap4Q99P47 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cntnap4Q99P47 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cntnap4Q99P47 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cntnap4Q99P47 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cntnap4Q99P47 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cntnap4Q99P47 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Cntnap4Q99P47 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cntnap4Q99P47 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cntnap4Q99P47 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cntnap4Q99P47 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cntnap4Q99P47 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cntnap4Q99P47 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cntnap4Q99P47 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cntnap4Q99P47 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cntnap4Q99P47 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cntnap4Q99P47 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cntnap4Q99P47 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cntnap4Q99P47 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cntnap4Q99P47 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cntnap4Q99P47 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cntnap4Q99P47 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cntnap4Q99P47 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cntnap4Q99P47 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cntnap4Q99P47 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cntnap4Q99P47 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cntnap4Q99P47 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cntnap4Q99P47 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cntnap4Q99P47 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cntnap4Q99P47 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Cntnap4Q99P47 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cntnap4Q99P47 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cntnap4Q99P47 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cntnap4Q99P47 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cntnap4Q99P47 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cntnap4Q99P47 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cntnap4Q99P47 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cntnap4Q99P47 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cntnap4Q99P47 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cntnap4Q99P47 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Cntnap4Q99P47 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cntnap4Q99P47 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cntnap4Q99P47 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Cntnap4Q99P47 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cntnap4Q99P47 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cntnap4Q99P47 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cntnap4Q99P47 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cntnap4Q99P47 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cntnap4Q99P47 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cntnap4Q99P47 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cntnap4Q99P47 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cntnap4Q99P47 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Cntnap4Q99P47 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cntnap4Q99P47 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cntnap4Q99P47 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cntnap4Q99P47 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cntnap4Q99P47 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cntnap4Q99P47 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cntnap4Q99P47 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Cntnap4Q99P47 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cntnap4Q99P47 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cntnap4Q99P47 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Cntnap4Q99P47 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cntnap4Q99P47 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cntnap4Q99P47 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cntnap4Q99P47 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cntnap4Q99P47 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cntnap4Q99P47 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cntnap4Q99P47 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cntnap4Q99P47 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cntnap4Q99P47 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cntnap4Q99P47 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cntnap4Q99P47 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cntnap4Q99P47 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cntnap4Q99P47 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cntnap4Q99P47 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cntnap4Q99P47 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cntnap4Q99P47 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cntnap4Q99P47 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cntnap4Q99P47 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cntnap4Q99P47 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cntnap4Q99P47 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cntnap4Q99P47 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cntnap4Q99P47 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cntnap4Q99P47 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cntnap4Q99P47 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cntnap4Q99P47 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cntnap4Q99P47 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cntnap4Q99P47 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cntnap4Q99P47 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cntnap4Q99P47 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cntnap4Q99P47 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cntnap4Q99P47 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cntnap4Q99P47 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cntnap4Q99P47 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cntnap4Q99P47 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cntnap4Q99P47 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cntnap4Q99P47 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cntnap4Q99P47 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cntnap4Q99P47 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cntnap4Q99P47 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms