Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tdrd1Q99MV1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tdrd1Q99MV1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Tdrd1Q99MV1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tdrd1Q99MV1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tdrd1Q99MV1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tdrd1Q99MV1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tdrd1Q99MV1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tdrd1Q99MV1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tdrd1Q99MV1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tdrd1Q99MV1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tdrd1Q99MV1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tdrd1Q99MV1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tdrd1Q99MV1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tdrd1Q99MV1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tdrd1Q99MV1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tdrd1Q99MV1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Tdrd1Q99MV1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tdrd1Q99MV1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tdrd1Q99MV1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tdrd1Q99MV1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tdrd1Q99MV1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tdrd1Q99MV1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tdrd1Q99MV1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tdrd1Q99MV1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tdrd1Q99MV1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tdrd1Q99MV1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tdrd1Q99MV1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tdrd1Q99MV1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tdrd1Q99MV1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tdrd1Q99MV1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tdrd1Q99MV1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tdrd1Q99MV1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tdrd1Q99MV1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tdrd1Q99MV1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tdrd1Q99MV1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Tdrd1Q99MV1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tdrd1Q99MV1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tdrd1Q99MV1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tdrd1Q99MV1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tdrd1Q99MV1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tdrd1Q99MV1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tdrd1Q99MV1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tdrd1Q99MV1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tdrd1Q99MV1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tdrd1Q99MV1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tdrd1Q99MV1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tdrd1Q99MV1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tdrd1Q99MV1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tdrd1Q99MV1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tdrd1Q99MV1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tdrd1Q99MV1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tdrd1Q99MV1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tdrd1Q99MV1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tdrd1Q99MV1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tdrd1Q99MV1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tdrd1Q99MV1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Tdrd1Q99MV1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tdrd1Q99MV1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tdrd1Q99MV1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tdrd1Q99MV1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tdrd1Q99MV1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tdrd1Q99MV1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tdrd1Q99MV1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tdrd1Q99MV1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tdrd1Q99MV1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tdrd1Q99MV1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Tdrd1Q99MV1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tdrd1Q99MV1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tdrd1Q99MV1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tdrd1Q99MV1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Tdrd1Q99MV1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tdrd1Q99MV1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tdrd1Q99MV1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Tdrd1Q99MV1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tdrd1Q99MV1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tdrd1Q99MV1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tdrd1Q99MV1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tdrd1Q99MV1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tdrd1Q99MV1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tdrd1Q99MV1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tdrd1Q99MV1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tdrd1Q99MV1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tdrd1Q99MV1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tdrd1Q99MV1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tdrd1Q99MV1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tdrd1Q99MV1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tdrd1Q99MV1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Tdrd1Q99MV1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tdrd1Q99MV1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tdrd1Q99MV1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tdrd1Q99MV1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tdrd1Q99MV1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tdrd1Q99MV1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tdrd1Q99MV1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tdrd1Q99MV1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tdrd1Q99MV1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tdrd1Q99MV1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tdrd1Q99MV1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tdrd1Q99MV1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms