Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG4

Ttc5, Tetratricopeptide repeat protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc5Q99LG4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ttc5Q99LG4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ttc5Q99LG4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Ttc5Q99LG4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Ttc5Q99LG4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ttc5Q99LG4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Ttc5Q99LG4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ttc5Q99LG4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ttc5Q99LG4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ttc5Q99LG4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ttc5Q99LG4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ttc5Q99LG4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ttc5Q99LG4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ttc5Q99LG4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ttc5Q99LG4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ttc5Q99LG4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Ttc5Q99LG4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ttc5Q99LG4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Ttc5Q99LG4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ttc5Q99LG4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ttc5Q99LG4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ttc5Q99LG4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ttc5Q99LG4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ttc5Q99LG4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ttc5Q99LG4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ttc5Q99LG4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ttc5Q99LG4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ttc5Q99LG4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ttc5Q99LG4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ttc5Q99LG4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ttc5Q99LG4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ttc5Q99LG4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ttc5Q99LG4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Ttc5Q99LG4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ttc5Q99LG4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ttc5Q99LG4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ttc5Q99LG4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Ttc5Q99LG4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ttc5Q99LG4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ttc5Q99LG4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ttc5Q99LG4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ttc5Q99LG4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ttc5Q99LG4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Ttc5Q99LG4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ttc5Q99LG4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Ttc5Q99LG4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ttc5Q99LG4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ttc5Q99LG4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ttc5Q99LG4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ttc5Q99LG4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ttc5Q99LG4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ttc5Q99LG4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ttc5Q99LG4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ttc5Q99LG4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ttc5Q99LG4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ttc5Q99LG4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ttc5Q99LG4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ttc5Q99LG4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ttc5Q99LG4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ttc5Q99LG4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ttc5Q99LG4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ttc5Q99LG4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ttc5Q99LG4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Ttc5Q99LG4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ttc5Q99LG4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ttc5Q99LG4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ttc5Q99LG4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ttc5Q99LG4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ttc5Q99LG4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ttc5Q99LG4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ttc5Q99LG4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ttc5Q99LG4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ttc5Q99LG4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ttc5Q99LG4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Ttc5Q99LG4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Ttc5Q99LG4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ttc5Q99LG4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ttc5Q99LG4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ttc5Q99LG4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ttc5Q99LG4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ttc5Q99LG4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ttc5Q99LG4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ttc5Q99LG4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Ttc5Q99LG4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Ttc5Q99LG4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ttc5Q99LG4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ttc5Q99LG4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ttc5Q99LG4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ttc5Q99LG4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ttc5Q99LG4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ttc5Q99LG4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ttc5Q99LG4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ttc5Q99LG4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ttc5Q99LG4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ttc5Q99LG4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ttc5Q99LG4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ttc5Q99LG4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ttc5Q99LG4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ttc5Q99LG4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ttc5Q99LG4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms