Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG2

Tnpo2, Transportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo2Q99LG2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tnpo2Q99LG2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tnpo2Q99LG2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tnpo2Q99LG2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tnpo2Q99LG2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tnpo2Q99LG2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tnpo2Q99LG2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tnpo2Q99LG2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tnpo2Q99LG2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tnpo2Q99LG2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tnpo2Q99LG2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tnpo2Q99LG2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tnpo2Q99LG2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tnpo2Q99LG2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tnpo2Q99LG2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tnpo2Q99LG2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tnpo2Q99LG2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tnpo2Q99LG2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnpo2Q99LG2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnpo2Q99LG2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnpo2Q99LG2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnpo2Q99LG2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnpo2Q99LG2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tnpo2Q99LG2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tnpo2Q99LG2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tnpo2Q99LG2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tnpo2Q99LG2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tnpo2Q99LG2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tnpo2Q99LG2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tnpo2Q99LG2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tnpo2Q99LG2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tnpo2Q99LG2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tnpo2Q99LG2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tnpo2Q99LG2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tnpo2Q99LG2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tnpo2Q99LG2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tnpo2Q99LG2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tnpo2Q99LG2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tnpo2Q99LG2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tnpo2Q99LG2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tnpo2Q99LG2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Tnpo2Q99LG2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tnpo2Q99LG2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tnpo2Q99LG2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tnpo2Q99LG2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tnpo2Q99LG2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tnpo2Q99LG2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tnpo2Q99LG2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tnpo2Q99LG2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tnpo2Q99LG2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tnpo2Q99LG2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tnpo2Q99LG2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tnpo2Q99LG2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tnpo2Q99LG2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tnpo2Q99LG2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tnpo2Q99LG2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tnpo2Q99LG2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tnpo2Q99LG2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tnpo2Q99LG2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Tnpo2Q99LG2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tnpo2Q99LG2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tnpo2Q99LG2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tnpo2Q99LG2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tnpo2Q99LG2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tnpo2Q99LG2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tnpo2Q99LG2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tnpo2Q99LG2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tnpo2Q99LG2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tnpo2Q99LG2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tnpo2Q99LG2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tnpo2Q99LG2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tnpo2Q99LG2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tnpo2Q99LG2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tnpo2Q99LG2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tnpo2Q99LG2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tnpo2Q99LG2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tnpo2Q99LG2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tnpo2Q99LG2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tnpo2Q99LG2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tnpo2Q99LG2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tnpo2Q99LG2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tnpo2Q99LG2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tnpo2Q99LG2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tnpo2Q99LG2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tnpo2Q99LG2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Tnpo2Q99LG2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tnpo2Q99LG2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tnpo2Q99LG2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tnpo2Q99LG2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tnpo2Q99LG2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tnpo2Q99LG2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tnpo2Q99LG2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tnpo2Q99LG2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tnpo2Q99LG2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tnpo2Q99LG2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tnpo2Q99LG2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tnpo2Q99LG2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tnpo2Q99LG2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tnpo2Q99LG2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tnpo2Q99LG2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms