Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE3

Lysmd3, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lysmd3Q99LE3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lysmd3Q99LE3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lysmd3Q99LE3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lysmd3Q99LE3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lysmd3Q99LE3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lysmd3Q99LE3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lysmd3Q99LE3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lysmd3Q99LE3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lysmd3Q99LE3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lysmd3Q99LE3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lysmd3Q99LE3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lysmd3Q99LE3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lysmd3Q99LE3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lysmd3Q99LE3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lysmd3Q99LE3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lysmd3Q99LE3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lysmd3Q99LE3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lysmd3Q99LE3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Lysmd3Q99LE3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lysmd3Q99LE3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lysmd3Q99LE3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lysmd3Q99LE3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lysmd3Q99LE3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lysmd3Q99LE3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lysmd3Q99LE3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lysmd3Q99LE3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lysmd3Q99LE3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lysmd3Q99LE3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lysmd3Q99LE3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lysmd3Q99LE3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lysmd3Q99LE3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lysmd3Q99LE3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lysmd3Q99LE3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lysmd3Q99LE3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lysmd3Q99LE3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lysmd3Q99LE3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lysmd3Q99LE3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Lysmd3Q99LE3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Lysmd3Q99LE3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lysmd3Q99LE3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lysmd3Q99LE3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Lysmd3Q99LE3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Lysmd3Q99LE3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lysmd3Q99LE3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lysmd3Q99LE3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lysmd3Q99LE3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lysmd3Q99LE3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lysmd3Q99LE3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lysmd3Q99LE3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lysmd3Q99LE3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lysmd3Q99LE3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Lysmd3Q99LE3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Lysmd3Q99LE3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lysmd3Q99LE3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Lysmd3Q99LE3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lysmd3Q99LE3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lysmd3Q99LE3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lysmd3Q99LE3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lysmd3Q99LE3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lysmd3Q99LE3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lysmd3Q99LE3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lysmd3Q99LE3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lysmd3Q99LE3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lysmd3Q99LE3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lysmd3Q99LE3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lysmd3Q99LE3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lysmd3Q99LE3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lysmd3Q99LE3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lysmd3Q99LE3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lysmd3Q99LE3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lysmd3Q99LE3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lysmd3Q99LE3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lysmd3Q99LE3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lysmd3Q99LE3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lysmd3Q99LE3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lysmd3Q99LE3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lysmd3Q99LE3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lysmd3Q99LE3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lysmd3Q99LE3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lysmd3Q99LE3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lysmd3Q99LE3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lysmd3Q99LE3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lysmd3Q99LE3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lysmd3Q99LE3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lysmd3Q99LE3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lysmd3Q99LE3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lysmd3Q99LE3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lysmd3Q99LE3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Lysmd3Q99LE3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lysmd3Q99LE3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lysmd3Q99LE3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lysmd3Q99LE3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lysmd3Q99LE3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lysmd3Q99LE3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lysmd3Q99LE3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lysmd3Q99LE3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lysmd3Q99LE3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Lysmd3Q99LE3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lysmd3Q99LE3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lysmd3Q99LE3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.8 ms