Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE1

Rilpl2, RILP-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rilpl2Q99LE1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rilpl2Q99LE1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rilpl2Q99LE1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rilpl2Q99LE1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rilpl2Q99LE1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rilpl2Q99LE1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rilpl2Q99LE1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rilpl2Q99LE1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rilpl2Q99LE1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rilpl2Q99LE1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rilpl2Q99LE1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Rilpl2Q99LE1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rilpl2Q99LE1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rilpl2Q99LE1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rilpl2Q99LE1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rilpl2Q99LE1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rilpl2Q99LE1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rilpl2Q99LE1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rilpl2Q99LE1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rilpl2Q99LE1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rilpl2Q99LE1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rilpl2Q99LE1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rilpl2Q99LE1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rilpl2Q99LE1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Rilpl2Q99LE1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rilpl2Q99LE1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rilpl2Q99LE1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rilpl2Q99LE1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rilpl2Q99LE1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Rilpl2Q99LE1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rilpl2Q99LE1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rilpl2Q99LE1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rilpl2Q99LE1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rilpl2Q99LE1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rilpl2Q99LE1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rilpl2Q99LE1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rilpl2Q99LE1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rilpl2Q99LE1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rilpl2Q99LE1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rilpl2Q99LE1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rilpl2Q99LE1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rilpl2Q99LE1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rilpl2Q99LE1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rilpl2Q99LE1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rilpl2Q99LE1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rilpl2Q99LE1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rilpl2Q99LE1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rilpl2Q99LE1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rilpl2Q99LE1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rilpl2Q99LE1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rilpl2Q99LE1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rilpl2Q99LE1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rilpl2Q99LE1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rilpl2Q99LE1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rilpl2Q99LE1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rilpl2Q99LE1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rilpl2Q99LE1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rilpl2Q99LE1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rilpl2Q99LE1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rilpl2Q99LE1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rilpl2Q99LE1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rilpl2Q99LE1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rilpl2Q99LE1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rilpl2Q99LE1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rilpl2Q99LE1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rilpl2Q99LE1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rilpl2Q99LE1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rilpl2Q99LE1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rilpl2Q99LE1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rilpl2Q99LE1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rilpl2Q99LE1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rilpl2Q99LE1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rilpl2Q99LE1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rilpl2Q99LE1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rilpl2Q99LE1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rilpl2Q99LE1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rilpl2Q99LE1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Rilpl2Q99LE1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rilpl2Q99LE1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rilpl2Q99LE1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rilpl2Q99LE1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Rilpl2Q99LE1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rilpl2Q99LE1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rilpl2Q99LE1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rilpl2Q99LE1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rilpl2Q99LE1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rilpl2Q99LE1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rilpl2Q99LE1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rilpl2Q99LE1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rilpl2Q99LE1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rilpl2Q99LE1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rilpl2Q99LE1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rilpl2Q99LE1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rilpl2Q99LE1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rilpl2Q99LE1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rilpl2Q99LE1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rilpl2Q99LE1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rilpl2Q99LE1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rilpl2Q99LE1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rilpl2Q99LE1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms