Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gps1Q99LD4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gps1Q99LD4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gps1Q99LD4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gps1Q99LD4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gps1Q99LD4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gps1Q99LD4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gps1Q99LD4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gps1Q99LD4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gps1Q99LD4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gps1Q99LD4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gps1Q99LD4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gps1Q99LD4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gps1Q99LD4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gps1Q99LD4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gps1Q99LD4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Gps1Q99LD4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Gps1Q99LD4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gps1Q99LD4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gps1Q99LD4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Gps1Q99LD4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gps1Q99LD4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gps1Q99LD4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gps1Q99LD4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gps1Q99LD4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gps1Q99LD4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gps1Q99LD4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gps1Q99LD4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gps1Q99LD4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gps1Q99LD4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gps1Q99LD4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gps1Q99LD4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gps1Q99LD4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Gps1Q99LD4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gps1Q99LD4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gps1Q99LD4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gps1Q99LD4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Gps1Q99LD4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gps1Q99LD4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gps1Q99LD4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gps1Q99LD4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gps1Q99LD4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gps1Q99LD4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gps1Q99LD4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gps1Q99LD4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gps1Q99LD4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gps1Q99LD4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gps1Q99LD4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gps1Q99LD4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gps1Q99LD4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gps1Q99LD4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Gps1Q99LD4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gps1Q99LD4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gps1Q99LD4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gps1Q99LD4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gps1Q99LD4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gps1Q99LD4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gps1Q99LD4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gps1Q99LD4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gps1Q99LD4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gps1Q99LD4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gps1Q99LD4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gps1Q99LD4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gps1Q99LD4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gps1Q99LD4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gps1Q99LD4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gps1Q99LD4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gps1Q99LD4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gps1Q99LD4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gps1Q99LD4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gps1Q99LD4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gps1Q99LD4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gps1Q99LD4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Gps1Q99LD4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gps1Q99LD4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Gps1Q99LD4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gps1Q99LD4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Gps1Q99LD4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gps1Q99LD4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gps1Q99LD4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gps1Q99LD4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gps1Q99LD4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gps1Q99LD4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gps1Q99LD4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gps1Q99LD4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gps1Q99LD4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gps1Q99LD4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gps1Q99LD4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gps1Q99LD4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gps1Q99LD4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gps1Q99LD4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gps1Q99LD4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gps1Q99LD4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gps1Q99LD4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gps1Q99LD4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Gps1Q99LD4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gps1Q99LD4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gps1Q99LD4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gps1Q99LD4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gps1Q99LD4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms