Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ubxn2aQ99KJ0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ubxn2aQ99KJ0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ubxn2aQ99KJ0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ubxn2aQ99KJ0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ubxn2aQ99KJ0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ubxn2aQ99KJ0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ubxn2aQ99KJ0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ubxn2aQ99KJ0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ubxn2aQ99KJ0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ubxn2aQ99KJ0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ubxn2aQ99KJ0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ubxn2aQ99KJ0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ubxn2aQ99KJ0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ubxn2aQ99KJ0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ubxn2aQ99KJ0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ubxn2aQ99KJ0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ubxn2aQ99KJ0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ubxn2aQ99KJ0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ubxn2aQ99KJ0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ubxn2aQ99KJ0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ubxn2aQ99KJ0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ubxn2aQ99KJ0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ubxn2aQ99KJ0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ubxn2aQ99KJ0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ubxn2aQ99KJ0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ubxn2aQ99KJ0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ubxn2aQ99KJ0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ubxn2aQ99KJ0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ubxn2aQ99KJ0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ubxn2aQ99KJ0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ubxn2aQ99KJ0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Ubxn2aQ99KJ0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ubxn2aQ99KJ0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ubxn2aQ99KJ0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ubxn2aQ99KJ0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ubxn2aQ99KJ0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ubxn2aQ99KJ0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ubxn2aQ99KJ0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ubxn2aQ99KJ0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ubxn2aQ99KJ0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ubxn2aQ99KJ0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ubxn2aQ99KJ0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ubxn2aQ99KJ0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ubxn2aQ99KJ0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ubxn2aQ99KJ0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ubxn2aQ99KJ0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ubxn2aQ99KJ0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ubxn2aQ99KJ0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ubxn2aQ99KJ0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ubxn2aQ99KJ0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ubxn2aQ99KJ0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ubxn2aQ99KJ0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ubxn2aQ99KJ0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ubxn2aQ99KJ0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ubxn2aQ99KJ0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ubxn2aQ99KJ0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ubxn2aQ99KJ0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ubxn2aQ99KJ0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ubxn2aQ99KJ0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ubxn2aQ99KJ0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ubxn2aQ99KJ0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ubxn2aQ99KJ0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ubxn2aQ99KJ0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ubxn2aQ99KJ0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ubxn2aQ99KJ0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ubxn2aQ99KJ0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ubxn2aQ99KJ0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ubxn2aQ99KJ0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ubxn2aQ99KJ0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ubxn2aQ99KJ0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Ubxn2aQ99KJ0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ubxn2aQ99KJ0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ubxn2aQ99KJ0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ubxn2aQ99KJ0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ubxn2aQ99KJ0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ubxn2aQ99KJ0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ubxn2aQ99KJ0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ubxn2aQ99KJ0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ubxn2aQ99KJ0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ubxn2aQ99KJ0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ubxn2aQ99KJ0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ubxn2aQ99KJ0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ubxn2aQ99KJ0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ubxn2aQ99KJ0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ubxn2aQ99KJ0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ubxn2aQ99KJ0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ubxn2aQ99KJ0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ubxn2aQ99KJ0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ubxn2aQ99KJ0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ubxn2aQ99KJ0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Ubxn2aQ99KJ0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ubxn2aQ99KJ0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ubxn2aQ99KJ0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ubxn2aQ99KJ0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms