Protein–RNA interactions for Protein: Q99K23

Ufsp2, Ufm1-specific protease 2, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufsp2Q99K23 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ufsp2Q99K23 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ufsp2Q99K23 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ufsp2Q99K23 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ufsp2Q99K23 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ufsp2Q99K23 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ufsp2Q99K23 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ufsp2Q99K23 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ufsp2Q99K23 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ufsp2Q99K23 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ufsp2Q99K23 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ufsp2Q99K23 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ufsp2Q99K23 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ufsp2Q99K23 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ufsp2Q99K23 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ufsp2Q99K23 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ufsp2Q99K23 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ufsp2Q99K23 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ufsp2Q99K23 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ufsp2Q99K23 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ufsp2Q99K23 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ufsp2Q99K23 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ufsp2Q99K23 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ufsp2Q99K23 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ufsp2Q99K23 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ufsp2Q99K23 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ufsp2Q99K23 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ufsp2Q99K23 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ufsp2Q99K23 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ufsp2Q99K23 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ufsp2Q99K23 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ufsp2Q99K23 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ufsp2Q99K23 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ufsp2Q99K23 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ufsp2Q99K23 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ufsp2Q99K23 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ufsp2Q99K23 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ufsp2Q99K23 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ufsp2Q99K23 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ufsp2Q99K23 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ufsp2Q99K23 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ufsp2Q99K23 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ufsp2Q99K23 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ufsp2Q99K23 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ufsp2Q99K23 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ufsp2Q99K23 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ufsp2Q99K23 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ufsp2Q99K23 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ufsp2Q99K23 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ufsp2Q99K23 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ufsp2Q99K23 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ufsp2Q99K23 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ufsp2Q99K23 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ufsp2Q99K23 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ufsp2Q99K23 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ufsp2Q99K23 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ufsp2Q99K23 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ufsp2Q99K23 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ufsp2Q99K23 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ufsp2Q99K23 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ufsp2Q99K23 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ufsp2Q99K23 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ufsp2Q99K23 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ufsp2Q99K23 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ufsp2Q99K23 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ufsp2Q99K23 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ufsp2Q99K23 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ufsp2Q99K23 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ufsp2Q99K23 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ufsp2Q99K23 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ufsp2Q99K23 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ufsp2Q99K23 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ufsp2Q99K23 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ufsp2Q99K23 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ufsp2Q99K23 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ufsp2Q99K23 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ufsp2Q99K23 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ufsp2Q99K23 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ufsp2Q99K23 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ufsp2Q99K23 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ufsp2Q99K23 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ufsp2Q99K23 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ufsp2Q99K23 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ufsp2Q99K23 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ufsp2Q99K23 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ufsp2Q99K23 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ufsp2Q99K23 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ufsp2Q99K23 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ufsp2Q99K23 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ufsp2Q99K23 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ufsp2Q99K23 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ufsp2Q99K23 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ufsp2Q99K23 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ufsp2Q99K23 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Ufsp2Q99K23 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ufsp2Q99K23 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ufsp2Q99K23 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ufsp2Q99K23 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ufsp2Q99K23 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ufsp2Q99K23 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms