Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Higd1bQ99JY6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Higd1bQ99JY6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Higd1bQ99JY6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Higd1bQ99JY6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Higd1bQ99JY6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Higd1bQ99JY6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Higd1bQ99JY6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Higd1bQ99JY6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Higd1bQ99JY6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Higd1bQ99JY6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Higd1bQ99JY6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Higd1bQ99JY6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Higd1bQ99JY6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Higd1bQ99JY6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Higd1bQ99JY6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Higd1bQ99JY6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Higd1bQ99JY6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Higd1bQ99JY6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Higd1bQ99JY6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Higd1bQ99JY6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Higd1bQ99JY6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Higd1bQ99JY6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Higd1bQ99JY6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Higd1bQ99JY6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Higd1bQ99JY6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Higd1bQ99JY6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Higd1bQ99JY6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Higd1bQ99JY6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Higd1bQ99JY6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Higd1bQ99JY6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Higd1bQ99JY6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Higd1bQ99JY6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Higd1bQ99JY6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Higd1bQ99JY6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Higd1bQ99JY6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Higd1bQ99JY6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Higd1bQ99JY6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Higd1bQ99JY6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Higd1bQ99JY6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Higd1bQ99JY6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Higd1bQ99JY6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Higd1bQ99JY6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Higd1bQ99JY6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Higd1bQ99JY6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Higd1bQ99JY6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Higd1bQ99JY6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Higd1bQ99JY6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Higd1bQ99JY6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Higd1bQ99JY6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Higd1bQ99JY6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Higd1bQ99JY6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Higd1bQ99JY6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Higd1bQ99JY6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Higd1bQ99JY6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Higd1bQ99JY6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Higd1bQ99JY6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Higd1bQ99JY6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Higd1bQ99JY6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Higd1bQ99JY6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Higd1bQ99JY6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Higd1bQ99JY6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Higd1bQ99JY6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Higd1bQ99JY6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Higd1bQ99JY6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Higd1bQ99JY6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Higd1bQ99JY6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Higd1bQ99JY6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Higd1bQ99JY6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Higd1bQ99JY6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Higd1bQ99JY6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Higd1bQ99JY6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Higd1bQ99JY6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Higd1bQ99JY6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Higd1bQ99JY6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Higd1bQ99JY6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Higd1bQ99JY6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Higd1bQ99JY6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Higd1bQ99JY6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Higd1bQ99JY6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Higd1bQ99JY6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Higd1bQ99JY6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Higd1bQ99JY6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Higd1bQ99JY6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Higd1bQ99JY6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Higd1bQ99JY6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Higd1bQ99JY6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Higd1bQ99JY6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Higd1bQ99JY6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Higd1bQ99JY6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Higd1bQ99JY6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Higd1bQ99JY6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Higd1bQ99JY6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Higd1bQ99JY6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Higd1bQ99JY6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Higd1bQ99JY6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Higd1bQ99JY6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Higd1bQ99JY6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Higd1bQ99JY6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Higd1bQ99JY6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms