Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW5

Epcam, Epithelial cell adhesion molecule, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EpcamQ99JW5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EpcamQ99JW5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EpcamQ99JW5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EpcamQ99JW5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EpcamQ99JW5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EpcamQ99JW5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EpcamQ99JW5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EpcamQ99JW5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EpcamQ99JW5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EpcamQ99JW5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EpcamQ99JW5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EpcamQ99JW5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EpcamQ99JW5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EpcamQ99JW5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EpcamQ99JW5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EpcamQ99JW5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EpcamQ99JW5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EpcamQ99JW5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
EpcamQ99JW5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EpcamQ99JW5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EpcamQ99JW5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EpcamQ99JW5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EpcamQ99JW5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EpcamQ99JW5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EpcamQ99JW5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EpcamQ99JW5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EpcamQ99JW5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EpcamQ99JW5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EpcamQ99JW5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EpcamQ99JW5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EpcamQ99JW5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EpcamQ99JW5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EpcamQ99JW5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EpcamQ99JW5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EpcamQ99JW5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EpcamQ99JW5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EpcamQ99JW5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EpcamQ99JW5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EpcamQ99JW5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EpcamQ99JW5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EpcamQ99JW5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EpcamQ99JW5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EpcamQ99JW5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EpcamQ99JW5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EpcamQ99JW5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EpcamQ99JW5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EpcamQ99JW5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EpcamQ99JW5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EpcamQ99JW5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EpcamQ99JW5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EpcamQ99JW5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EpcamQ99JW5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EpcamQ99JW5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EpcamQ99JW5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EpcamQ99JW5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EpcamQ99JW5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EpcamQ99JW5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EpcamQ99JW5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EpcamQ99JW5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EpcamQ99JW5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EpcamQ99JW5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EpcamQ99JW5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EpcamQ99JW5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EpcamQ99JW5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EpcamQ99JW5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EpcamQ99JW5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EpcamQ99JW5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EpcamQ99JW5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EpcamQ99JW5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EpcamQ99JW5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EpcamQ99JW5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EpcamQ99JW5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EpcamQ99JW5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EpcamQ99JW5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EpcamQ99JW5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EpcamQ99JW5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EpcamQ99JW5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EpcamQ99JW5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EpcamQ99JW5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
EpcamQ99JW5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
EpcamQ99JW5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EpcamQ99JW5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EpcamQ99JW5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EpcamQ99JW5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EpcamQ99JW5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EpcamQ99JW5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EpcamQ99JW5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
EpcamQ99JW5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EpcamQ99JW5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EpcamQ99JW5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EpcamQ99JW5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EpcamQ99JW5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EpcamQ99JW5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EpcamQ99JW5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EpcamQ99JW5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EpcamQ99JW5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EpcamQ99JW5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EpcamQ99JW5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EpcamQ99JW5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EpcamQ99JW5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms